Protein–RNA interactions for Protein: O89006

Magea1, Magea1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Magea1O89006 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Magea1O89006 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Magea1O89006 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Magea1O89006 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Magea1O89006 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Magea1O89006 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Magea1O89006 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Magea1O89006 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Magea1O89006 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Magea1O89006 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Magea1O89006 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Magea1O89006 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Magea1O89006 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Magea1O89006 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Magea1O89006 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Magea1O89006 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Magea1O89006 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Magea1O89006 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Magea1O89006 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Magea1O89006 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Magea1O89006 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Magea1O89006 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Magea1O89006 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Magea1O89006 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Magea1O89006 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Magea1O89006 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Magea1O89006 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Magea1O89006 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Magea1O89006 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Magea1O89006 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Magea1O89006 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Magea1O89006 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Magea1O89006 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Magea1O89006 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Magea1O89006 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Magea1O89006 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Magea1O89006 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Magea1O89006 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Magea1O89006 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Magea1O89006 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Magea1O89006 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Magea1O89006 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Magea1O89006 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Magea1O89006 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Magea1O89006 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Magea1O89006 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Magea1O89006 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Magea1O89006 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Magea1O89006 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Magea1O89006 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Magea1O89006 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Magea1O89006 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Magea1O89006 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Magea1O89006 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Magea1O89006 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Magea1O89006 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Magea1O89006 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Magea1O89006 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Magea1O89006 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Magea1O89006 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Magea1O89006 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Magea1O89006 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Magea1O89006 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Magea1O89006 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Magea1O89006 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Magea1O89006 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Magea1O89006 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Magea1O89006 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Magea1O89006 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Magea1O89006 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Magea1O89006 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Magea1O89006 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Magea1O89006 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Magea1O89006 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Magea1O89006 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Magea1O89006 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Magea1O89006 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Magea1O89006 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Magea1O89006 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Magea1O89006 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Magea1O89006 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Magea1O89006 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Magea1O89006 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Magea1O89006 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Magea1O89006 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Magea1O89006 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Magea1O89006 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Magea1O89006 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Magea1O89006 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Magea1O89006 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Magea1O89006 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Magea1O89006 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Magea1O89006 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Magea1O89006 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Magea1O89006 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Magea1O89006 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Magea1O89006 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Magea1O89006 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Magea1O89006 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Magea1O89006 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms