Protein–RNA interactions for Protein: O88974

Setdb1, Histone-lysine N-methyltransferase SETDB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setdb1O88974 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Setdb1O88974 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Setdb1O88974 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Setdb1O88974 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Setdb1O88974 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Setdb1O88974 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Setdb1O88974 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Setdb1O88974 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Setdb1O88974 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Setdb1O88974 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Setdb1O88974 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Setdb1O88974 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Setdb1O88974 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Setdb1O88974 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Setdb1O88974 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Setdb1O88974 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Setdb1O88974 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Setdb1O88974 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Setdb1O88974 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Setdb1O88974 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Setdb1O88974 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Setdb1O88974 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Setdb1O88974 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Setdb1O88974 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Setdb1O88974 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Setdb1O88974 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Setdb1O88974 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Setdb1O88974 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Setdb1O88974 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Setdb1O88974 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Setdb1O88974 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Setdb1O88974 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Setdb1O88974 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Setdb1O88974 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Setdb1O88974 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Setdb1O88974 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Setdb1O88974 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Setdb1O88974 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Setdb1O88974 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Setdb1O88974 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Setdb1O88974 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Setdb1O88974 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Setdb1O88974 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Setdb1O88974 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Setdb1O88974 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Setdb1O88974 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Setdb1O88974 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Setdb1O88974 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Setdb1O88974 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Setdb1O88974 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Setdb1O88974 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Setdb1O88974 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Setdb1O88974 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Setdb1O88974 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Setdb1O88974 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Setdb1O88974 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Setdb1O88974 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Setdb1O88974 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Setdb1O88974 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Setdb1O88974 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Setdb1O88974 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Setdb1O88974 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Setdb1O88974 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Setdb1O88974 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Setdb1O88974 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Setdb1O88974 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Setdb1O88974 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Setdb1O88974 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Setdb1O88974 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Setdb1O88974 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Setdb1O88974 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Setdb1O88974 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Setdb1O88974 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Setdb1O88974 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Setdb1O88974 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Setdb1O88974 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Setdb1O88974 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Setdb1O88974 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Setdb1O88974 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Setdb1O88974 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Setdb1O88974 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Setdb1O88974 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Setdb1O88974 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Setdb1O88974 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Setdb1O88974 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Setdb1O88974 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Setdb1O88974 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Setdb1O88974 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Setdb1O88974 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Setdb1O88974 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Setdb1O88974 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Setdb1O88974 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Setdb1O88974 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Setdb1O88974 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Setdb1O88974 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Setdb1O88974 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Setdb1O88974 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Setdb1O88974 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Setdb1O88974 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Setdb1O88974 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms