Protein–RNA interactions for Protein: O88968

Tcn2, Transcobalamin-2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcn2O88968 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tcn2O88968 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tcn2O88968 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tcn2O88968 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tcn2O88968 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tcn2O88968 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tcn2O88968 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tcn2O88968 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tcn2O88968 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tcn2O88968 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tcn2O88968 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tcn2O88968 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Tcn2O88968 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tcn2O88968 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tcn2O88968 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tcn2O88968 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tcn2O88968 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tcn2O88968 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tcn2O88968 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tcn2O88968 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tcn2O88968 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tcn2O88968 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tcn2O88968 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tcn2O88968 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tcn2O88968 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tcn2O88968 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tcn2O88968 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tcn2O88968 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tcn2O88968 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tcn2O88968 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tcn2O88968 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tcn2O88968 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tcn2O88968 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tcn2O88968 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tcn2O88968 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tcn2O88968 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tcn2O88968 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tcn2O88968 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tcn2O88968 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tcn2O88968 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tcn2O88968 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tcn2O88968 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tcn2O88968 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tcn2O88968 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tcn2O88968 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tcn2O88968 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tcn2O88968 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tcn2O88968 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tcn2O88968 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tcn2O88968 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tcn2O88968 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tcn2O88968 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tcn2O88968 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tcn2O88968 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tcn2O88968 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tcn2O88968 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tcn2O88968 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tcn2O88968 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tcn2O88968 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tcn2O88968 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tcn2O88968 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tcn2O88968 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tcn2O88968 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tcn2O88968 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tcn2O88968 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tcn2O88968 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tcn2O88968 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tcn2O88968 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tcn2O88968 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tcn2O88968 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tcn2O88968 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tcn2O88968 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tcn2O88968 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcn2O88968 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcn2O88968 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcn2O88968 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcn2O88968 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcn2O88968 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcn2O88968 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcn2O88968 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcn2O88968 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcn2O88968 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcn2O88968 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcn2O88968 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcn2O88968 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcn2O88968 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tcn2O88968 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tcn2O88968 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tcn2O88968 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tcn2O88968 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tcn2O88968 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tcn2O88968 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tcn2O88968 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tcn2O88968 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tcn2O88968 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tcn2O88968 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tcn2O88968 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tcn2O88968 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tcn2O88968 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tcn2O88968 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms