Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
BlmO88700 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
BlmO88700 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
BlmO88700 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
BlmO88700 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
BlmO88700 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
BlmO88700 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
BlmO88700 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
BlmO88700 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
BlmO88700 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
BlmO88700 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
BlmO88700 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
BlmO88700 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
BlmO88700 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
BlmO88700 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
BlmO88700 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
BlmO88700 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
BlmO88700 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
BlmO88700 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
BlmO88700 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
BlmO88700 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
BlmO88700 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
BlmO88700 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
BlmO88700 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
BlmO88700 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
BlmO88700 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
BlmO88700 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
BlmO88700 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
BlmO88700 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
BlmO88700 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
BlmO88700 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
BlmO88700 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
BlmO88700 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
BlmO88700 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
BlmO88700 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
BlmO88700 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
BlmO88700 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
BlmO88700 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
BlmO88700 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
BlmO88700 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
BlmO88700 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
BlmO88700 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
BlmO88700 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
BlmO88700 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
BlmO88700 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
BlmO88700 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
BlmO88700 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
BlmO88700 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
BlmO88700 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
BlmO88700 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
BlmO88700 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
BlmO88700 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
BlmO88700 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
BlmO88700 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
BlmO88700 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
BlmO88700 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
BlmO88700 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
BlmO88700 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
BlmO88700 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
BlmO88700 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
BlmO88700 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
BlmO88700 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
BlmO88700 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
BlmO88700 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
BlmO88700 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
BlmO88700 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
BlmO88700 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
BlmO88700 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
BlmO88700 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
BlmO88700 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
BlmO88700 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
BlmO88700 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
BlmO88700 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
BlmO88700 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
BlmO88700 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
BlmO88700 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
BlmO88700 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
BlmO88700 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
BlmO88700 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
BlmO88700 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
BlmO88700 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
BlmO88700 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
BlmO88700 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
BlmO88700 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
BlmO88700 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
BlmO88700 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
BlmO88700 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
BlmO88700 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
BlmO88700 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
BlmO88700 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
BlmO88700 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
BlmO88700 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
BlmO88700 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
BlmO88700 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
BlmO88700 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
BlmO88700 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
BlmO88700 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
BlmO88700 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
BlmO88700 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
BlmO88700 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms