Protein–RNA interactions for Protein: O88632

Sema3f, Semaphorin-3F, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3fO88632 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sema3fO88632 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sema3fO88632 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sema3fO88632 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sema3fO88632 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sema3fO88632 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sema3fO88632 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sema3fO88632 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sema3fO88632 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sema3fO88632 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sema3fO88632 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Sema3fO88632 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sema3fO88632 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sema3fO88632 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sema3fO88632 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sema3fO88632 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sema3fO88632 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema3fO88632 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema3fO88632 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema3fO88632 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema3fO88632 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema3fO88632 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema3fO88632 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema3fO88632 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema3fO88632 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sema3fO88632 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sema3fO88632 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sema3fO88632 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sema3fO88632 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sema3fO88632 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Sema3fO88632 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sema3fO88632 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Sema3fO88632 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sema3fO88632 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sema3fO88632 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema3fO88632 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema3fO88632 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema3fO88632 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema3fO88632 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema3fO88632 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema3fO88632 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema3fO88632 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema3fO88632 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema3fO88632 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema3fO88632 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema3fO88632 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema3fO88632 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema3fO88632 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema3fO88632 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema3fO88632 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema3fO88632 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema3fO88632 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema3fO88632 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema3fO88632 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema3fO88632 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema3fO88632 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema3fO88632 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sema3fO88632 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sema3fO88632 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sema3fO88632 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sema3fO88632 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sema3fO88632 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sema3fO88632 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sema3fO88632 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sema3fO88632 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sema3fO88632 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sema3fO88632 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sema3fO88632 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sema3fO88632 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sema3fO88632 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sema3fO88632 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sema3fO88632 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sema3fO88632 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Sema3fO88632 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sema3fO88632 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sema3fO88632 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sema3fO88632 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sema3fO88632 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Sema3fO88632 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sema3fO88632 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sema3fO88632 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sema3fO88632 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sema3fO88632 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Sema3fO88632 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Sema3fO88632 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sema3fO88632 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sema3fO88632 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sema3fO88632 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sema3fO88632 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sema3fO88632 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sema3fO88632 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sema3fO88632 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sema3fO88632 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sema3fO88632 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sema3fO88632 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sema3fO88632 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sema3fO88632 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sema3fO88632 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sema3fO88632 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sema3fO88632 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms