Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CntfrO88507 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CntfrO88507 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CntfrO88507 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CntfrO88507 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CntfrO88507 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CntfrO88507 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CntfrO88507 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CntfrO88507 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CntfrO88507 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CntfrO88507 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CntfrO88507 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CntfrO88507 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CntfrO88507 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CntfrO88507 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CntfrO88507 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CntfrO88507 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CntfrO88507 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CntfrO88507 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CntfrO88507 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CntfrO88507 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CntfrO88507 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CntfrO88507 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CntfrO88507 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CntfrO88507 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CntfrO88507 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CntfrO88507 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CntfrO88507 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CntfrO88507 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CntfrO88507 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CntfrO88507 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CntfrO88507 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CntfrO88507 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CntfrO88507 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CntfrO88507 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CntfrO88507 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CntfrO88507 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CntfrO88507 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CntfrO88507 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CntfrO88507 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CntfrO88507 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CntfrO88507 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CntfrO88507 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CntfrO88507 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CntfrO88507 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CntfrO88507 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CntfrO88507 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CntfrO88507 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CntfrO88507 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CntfrO88507 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CntfrO88507 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CntfrO88507 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CntfrO88507 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CntfrO88507 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CntfrO88507 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CntfrO88507 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CntfrO88507 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CntfrO88507 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CntfrO88507 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CntfrO88507 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CntfrO88507 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CntfrO88507 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CntfrO88507 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CntfrO88507 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CntfrO88507 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CntfrO88507 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CntfrO88507 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CntfrO88507 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CntfrO88507 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CntfrO88507 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CntfrO88507 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CntfrO88507 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CntfrO88507 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CntfrO88507 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CntfrO88507 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CntfrO88507 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CntfrO88507 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CntfrO88507 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CntfrO88507 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CntfrO88507 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CntfrO88507 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CntfrO88507 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CntfrO88507 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CntfrO88507 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CntfrO88507 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CntfrO88507 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CntfrO88507 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CntfrO88507 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CntfrO88507 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CntfrO88507 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CntfrO88507 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CntfrO88507 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CntfrO88507 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CntfrO88507 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CntfrO88507 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CntfrO88507 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CntfrO88507 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CntfrO88507 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CntfrO88507 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CntfrO88507 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms