Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnnt1O88346 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnnt1O88346 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnnt1O88346 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnnt1O88346 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnnt1O88346 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnnt1O88346 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnnt1O88346 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnnt1O88346 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnnt1O88346 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnnt1O88346 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnnt1O88346 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnnt1O88346 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnnt1O88346 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnnt1O88346 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnnt1O88346 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnnt1O88346 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tnnt1O88346 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tnnt1O88346 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tnnt1O88346 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tnnt1O88346 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tnnt1O88346 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tnnt1O88346 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tnnt1O88346 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tnnt1O88346 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tnnt1O88346 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tnnt1O88346 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnnt1O88346 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnnt1O88346 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnnt1O88346 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnnt1O88346 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnnt1O88346 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnnt1O88346 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnnt1O88346 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnnt1O88346 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnnt1O88346 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tnnt1O88346 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tnnt1O88346 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tnnt1O88346 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tnnt1O88346 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tnnt1O88346 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tnnt1O88346 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tnnt1O88346 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tnnt1O88346 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tnnt1O88346 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tnnt1O88346 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tnnt1O88346 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tnnt1O88346 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tnnt1O88346 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tnnt1O88346 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tnnt1O88346 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tnnt1O88346 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tnnt1O88346 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tnnt1O88346 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tnnt1O88346 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tnnt1O88346 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tnnt1O88346 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tnnt1O88346 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tnnt1O88346 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Tnnt1O88346 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tnnt1O88346 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tnnt1O88346 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnnt1O88346 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnnt1O88346 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnnt1O88346 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnnt1O88346 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tnnt1O88346 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tnnt1O88346 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tnnt1O88346 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tnnt1O88346 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Tnnt1O88346 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tnnt1O88346 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tnnt1O88346 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tnnt1O88346 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tnnt1O88346 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tnnt1O88346 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tnnt1O88346 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tnnt1O88346 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tnnt1O88346 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tnnt1O88346 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tnnt1O88346 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tnnt1O88346 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tnnt1O88346 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Tnnt1O88346 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tnnt1O88346 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tnnt1O88346 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tnnt1O88346 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tnnt1O88346 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tnnt1O88346 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tnnt1O88346 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tnnt1O88346 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnnt1O88346 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnnt1O88346 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnnt1O88346 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnnt1O88346 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnnt1O88346 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnnt1O88346 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnnt1O88346 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tnnt1O88346 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tnnt1O88346 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms