Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CtssO70370 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CtssO70370 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CtssO70370 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CtssO70370 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CtssO70370 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CtssO70370 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CtssO70370 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CtssO70370 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CtssO70370 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CtssO70370 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CtssO70370 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CtssO70370 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CtssO70370 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CtssO70370 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CtssO70370 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CtssO70370 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CtssO70370 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CtssO70370 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CtssO70370 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CtssO70370 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CtssO70370 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CtssO70370 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CtssO70370 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CtssO70370 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CtssO70370 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CtssO70370 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CtssO70370 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CtssO70370 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CtssO70370 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CtssO70370 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CtssO70370 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CtssO70370 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CtssO70370 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CtssO70370 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CtssO70370 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CtssO70370 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CtssO70370 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CtssO70370 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CtssO70370 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CtssO70370 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CtssO70370 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CtssO70370 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CtssO70370 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CtssO70370 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CtssO70370 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CtssO70370 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CtssO70370 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CtssO70370 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CtssO70370 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CtssO70370 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CtssO70370 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CtssO70370 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CtssO70370 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CtssO70370 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CtssO70370 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CtssO70370 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CtssO70370 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CtssO70370 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CtssO70370 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CtssO70370 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CtssO70370 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CtssO70370 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CtssO70370 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CtssO70370 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CtssO70370 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CtssO70370 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CtssO70370 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CtssO70370 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CtssO70370 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CtssO70370 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CtssO70370 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CtssO70370 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CtssO70370 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CtssO70370 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CtssO70370 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CtssO70370 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CtssO70370 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CtssO70370 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CtssO70370 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CtssO70370 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CtssO70370 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CtssO70370 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CtssO70370 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CtssO70370 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CtssO70370 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CtssO70370 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CtssO70370 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CtssO70370 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CtssO70370 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CtssO70370 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CtssO70370 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CtssO70370 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CtssO70370 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CtssO70370 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CtssO70370 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CtssO70370 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CtssO70370 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CtssO70370 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CtssO70370 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms