Protein–RNA interactions for Protein: O55234

Psmb5, Proteasome subunit beta type-5, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb5O55234 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psmb5O55234 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psmb5O55234 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psmb5O55234 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psmb5O55234 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psmb5O55234 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psmb5O55234 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psmb5O55234 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psmb5O55234 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psmb5O55234 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psmb5O55234 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Psmb5O55234 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psmb5O55234 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psmb5O55234 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psmb5O55234 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psmb5O55234 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psmb5O55234 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psmb5O55234 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psmb5O55234 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psmb5O55234 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psmb5O55234 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psmb5O55234 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psmb5O55234 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psmb5O55234 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psmb5O55234 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psmb5O55234 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psmb5O55234 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psmb5O55234 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psmb5O55234 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psmb5O55234 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psmb5O55234 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psmb5O55234 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psmb5O55234 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Psmb5O55234 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psmb5O55234 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psmb5O55234 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psmb5O55234 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psmb5O55234 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psmb5O55234 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psmb5O55234 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psmb5O55234 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psmb5O55234 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psmb5O55234 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psmb5O55234 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psmb5O55234 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psmb5O55234 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psmb5O55234 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psmb5O55234 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Psmb5O55234 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psmb5O55234 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psmb5O55234 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psmb5O55234 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psmb5O55234 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Psmb5O55234 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psmb5O55234 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psmb5O55234 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psmb5O55234 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psmb5O55234 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psmb5O55234 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psmb5O55234 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psmb5O55234 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psmb5O55234 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psmb5O55234 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psmb5O55234 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psmb5O55234 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psmb5O55234 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psmb5O55234 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psmb5O55234 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Psmb5O55234 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psmb5O55234 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psmb5O55234 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psmb5O55234 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psmb5O55234 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psmb5O55234 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmb5O55234 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmb5O55234 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmb5O55234 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmb5O55234 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmb5O55234 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmb5O55234 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmb5O55234 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmb5O55234 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmb5O55234 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmb5O55234 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmb5O55234 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmb5O55234 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmb5O55234 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmb5O55234 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmb5O55234 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmb5O55234 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmb5O55234 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmb5O55234 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psmb5O55234 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psmb5O55234 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psmb5O55234 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psmb5O55234 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Psmb5O55234 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psmb5O55234 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psmb5O55234 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psmb5O55234 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms