Protein–RNA interactions for Protein: O55230

Rad51d, DNA repair protein RAD51 homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad51dO55230 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rad51dO55230 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rad51dO55230 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rad51dO55230 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rad51dO55230 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rad51dO55230 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rad51dO55230 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rad51dO55230 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rad51dO55230 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rad51dO55230 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rad51dO55230 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rad51dO55230 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rad51dO55230 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rad51dO55230 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rad51dO55230 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rad51dO55230 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rad51dO55230 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rad51dO55230 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rad51dO55230 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rad51dO55230 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rad51dO55230 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rad51dO55230 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rad51dO55230 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rad51dO55230 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rad51dO55230 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rad51dO55230 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rad51dO55230 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rad51dO55230 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rad51dO55230 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rad51dO55230 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rad51dO55230 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rad51dO55230 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rad51dO55230 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rad51dO55230 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rad51dO55230 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rad51dO55230 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rad51dO55230 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rad51dO55230 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rad51dO55230 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rad51dO55230 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rad51dO55230 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rad51dO55230 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rad51dO55230 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rad51dO55230 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rad51dO55230 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rad51dO55230 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rad51dO55230 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms