Protein–RNA interactions for Protein: O55208

Figla, Factor in the germline alpha, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FiglaO55208 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FiglaO55208 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FiglaO55208 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FiglaO55208 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FiglaO55208 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FiglaO55208 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FiglaO55208 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FiglaO55208 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FiglaO55208 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FiglaO55208 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FiglaO55208 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FiglaO55208 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FiglaO55208 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FiglaO55208 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FiglaO55208 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FiglaO55208 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FiglaO55208 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FiglaO55208 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FiglaO55208 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FiglaO55208 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FiglaO55208 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FiglaO55208 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FiglaO55208 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FiglaO55208 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FiglaO55208 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FiglaO55208 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FiglaO55208 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FiglaO55208 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FiglaO55208 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FiglaO55208 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FiglaO55208 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FiglaO55208 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FiglaO55208 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FiglaO55208 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FiglaO55208 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FiglaO55208 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FiglaO55208 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FiglaO55208 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FiglaO55208 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FiglaO55208 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FiglaO55208 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FiglaO55208 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FiglaO55208 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FiglaO55208 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FiglaO55208 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FiglaO55208 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FiglaO55208 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FiglaO55208 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FiglaO55208 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
FiglaO55208 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FiglaO55208 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
FiglaO55208 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FiglaO55208 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FiglaO55208 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FiglaO55208 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FiglaO55208 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FiglaO55208 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FiglaO55208 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FiglaO55208 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FiglaO55208 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FiglaO55208 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FiglaO55208 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FiglaO55208 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FiglaO55208 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FiglaO55208 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FiglaO55208 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FiglaO55208 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FiglaO55208 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FiglaO55208 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FiglaO55208 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FiglaO55208 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FiglaO55208 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FiglaO55208 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FiglaO55208 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FiglaO55208 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FiglaO55208 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FiglaO55208 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FiglaO55208 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FiglaO55208 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FiglaO55208 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FiglaO55208 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FiglaO55208 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FiglaO55208 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FiglaO55208 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FiglaO55208 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FiglaO55208 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FiglaO55208 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FiglaO55208 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
FiglaO55208 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FiglaO55208 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FiglaO55208 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FiglaO55208 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FiglaO55208 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FiglaO55208 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FiglaO55208 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FiglaO55208 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FiglaO55208 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FiglaO55208 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FiglaO55208 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FiglaO55208 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms