Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp2a2O55143 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp2a2O55143 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp2a2O55143 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp2a2O55143 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp2a2O55143 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp2a2O55143 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp2a2O55143 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp2a2O55143 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp2a2O55143 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp2a2O55143 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp2a2O55143 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp2a2O55143 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp2a2O55143 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp2a2O55143 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp2a2O55143 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp2a2O55143 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp2a2O55143 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp2a2O55143 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp2a2O55143 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp2a2O55143 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp2a2O55143 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp2a2O55143 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp2a2O55143 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp2a2O55143 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp2a2O55143 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp2a2O55143 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp2a2O55143 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp2a2O55143 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp2a2O55143 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp2a2O55143 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atp2a2O55143 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atp2a2O55143 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atp2a2O55143 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atp2a2O55143 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atp2a2O55143 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atp2a2O55143 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atp2a2O55143 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atp2a2O55143 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atp2a2O55143 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atp2a2O55143 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atp2a2O55143 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atp2a2O55143 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp2a2O55143 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp2a2O55143 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp2a2O55143 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp2a2O55143 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp2a2O55143 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp2a2O55143 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp2a2O55143 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp2a2O55143 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp2a2O55143 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp2a2O55143 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp2a2O55143 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp2a2O55143 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp2a2O55143 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp2a2O55143 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp2a2O55143 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp2a2O55143 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp2a2O55143 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp2a2O55143 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp2a2O55143 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp2a2O55143 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp2a2O55143 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp2a2O55143 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp2a2O55143 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp2a2O55143 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp2a2O55143 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp2a2O55143 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp2a2O55143 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp2a2O55143 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp2a2O55143 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp2a2O55143 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp2a2O55143 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp2a2O55143 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp2a2O55143 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp2a2O55143 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp2a2O55143 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp2a2O55143 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp2a2O55143 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp2a2O55143 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp2a2O55143 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp2a2O55143 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp2a2O55143 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp2a2O55143 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp2a2O55143 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp2a2O55143 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp2a2O55143 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp2a2O55143 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp2a2O55143 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp2a2O55143 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp2a2O55143 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp2a2O55143 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp2a2O55143 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp2a2O55143 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp2a2O55143 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp2a2O55143 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp2a2O55143 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp2a2O55143 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp2a2O55143 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms