Protein–RNA interactions for Protein: O55126

Nipsnap2, Protein NipSnap homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap2O55126 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nipsnap2O55126 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nipsnap2O55126 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nipsnap2O55126 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nipsnap2O55126 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nipsnap2O55126 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nipsnap2O55126 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nipsnap2O55126 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nipsnap2O55126 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nipsnap2O55126 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nipsnap2O55126 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nipsnap2O55126 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nipsnap2O55126 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nipsnap2O55126 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nipsnap2O55126 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nipsnap2O55126 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nipsnap2O55126 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nipsnap2O55126 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nipsnap2O55126 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nipsnap2O55126 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Nipsnap2O55126 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nipsnap2O55126 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nipsnap2O55126 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Nipsnap2O55126 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nipsnap2O55126 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nipsnap2O55126 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nipsnap2O55126 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nipsnap2O55126 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nipsnap2O55126 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nipsnap2O55126 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nipsnap2O55126 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nipsnap2O55126 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nipsnap2O55126 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nipsnap2O55126 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nipsnap2O55126 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nipsnap2O55126 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nipsnap2O55126 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nipsnap2O55126 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nipsnap2O55126 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nipsnap2O55126 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nipsnap2O55126 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nipsnap2O55126 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Nipsnap2O55126 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nipsnap2O55126 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nipsnap2O55126 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nipsnap2O55126 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nipsnap2O55126 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nipsnap2O55126 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nipsnap2O55126 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nipsnap2O55126 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nipsnap2O55126 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nipsnap2O55126 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nipsnap2O55126 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nipsnap2O55126 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nipsnap2O55126 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nipsnap2O55126 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nipsnap2O55126 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nipsnap2O55126 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nipsnap2O55126 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nipsnap2O55126 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nipsnap2O55126 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nipsnap2O55126 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nipsnap2O55126 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nipsnap2O55126 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nipsnap2O55126 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nipsnap2O55126 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nipsnap2O55126 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nipsnap2O55126 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nipsnap2O55126 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nipsnap2O55126 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Nipsnap2O55126 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nipsnap2O55126 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nipsnap2O55126 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nipsnap2O55126 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nipsnap2O55126 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nipsnap2O55126 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nipsnap2O55126 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nipsnap2O55126 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nipsnap2O55126 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nipsnap2O55126 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nipsnap2O55126 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nipsnap2O55126 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nipsnap2O55126 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nipsnap2O55126 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nipsnap2O55126 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nipsnap2O55126 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nipsnap2O55126 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nipsnap2O55126 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nipsnap2O55126 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nipsnap2O55126 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nipsnap2O55126 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nipsnap2O55126 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nipsnap2O55126 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nipsnap2O55126 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nipsnap2O55126 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nipsnap2O55126 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nipsnap2O55126 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nipsnap2O55126 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nipsnap2O55126 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nipsnap2O55126 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms