Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dsg2O55111 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dsg2O55111 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dsg2O55111 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dsg2O55111 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dsg2O55111 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dsg2O55111 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Dsg2O55111 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Dsg2O55111 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Dsg2O55111 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Dsg2O55111 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dsg2O55111 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dsg2O55111 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dsg2O55111 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dsg2O55111 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dsg2O55111 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dsg2O55111 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dsg2O55111 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dsg2O55111 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dsg2O55111 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dsg2O55111 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dsg2O55111 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Dsg2O55111 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Dsg2O55111 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dsg2O55111 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dsg2O55111 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dsg2O55111 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dsg2O55111 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dsg2O55111 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dsg2O55111 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dsg2O55111 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Dsg2O55111 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Dsg2O55111 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dsg2O55111 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dsg2O55111 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dsg2O55111 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dsg2O55111 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dsg2O55111 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dsg2O55111 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dsg2O55111 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dsg2O55111 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dsg2O55111 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dsg2O55111 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dsg2O55111 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dsg2O55111 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dsg2O55111 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dsg2O55111 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dsg2O55111 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dsg2O55111 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dsg2O55111 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dsg2O55111 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dsg2O55111 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dsg2O55111 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dsg2O55111 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dsg2O55111 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dsg2O55111 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dsg2O55111 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Dsg2O55111 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dsg2O55111 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dsg2O55111 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Dsg2O55111 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Dsg2O55111 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dsg2O55111 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dsg2O55111 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dsg2O55111 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dsg2O55111 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dsg2O55111 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dsg2O55111 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dsg2O55111 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dsg2O55111 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dsg2O55111 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dsg2O55111 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dsg2O55111 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dsg2O55111 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dsg2O55111 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Dsg2O55111 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dsg2O55111 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dsg2O55111 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dsg2O55111 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dsg2O55111 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dsg2O55111 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dsg2O55111 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dsg2O55111 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dsg2O55111 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Dsg2O55111 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Dsg2O55111 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Dsg2O55111 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dsg2O55111 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dsg2O55111 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dsg2O55111 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dsg2O55111 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dsg2O55111 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Dsg2O55111 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dsg2O55111 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dsg2O55111 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dsg2O55111 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dsg2O55111 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dsg2O55111 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Dsg2O55111 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Dsg2O55111 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms