Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trappc3O55013 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trappc3O55013 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trappc3O55013 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trappc3O55013 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trappc3O55013 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trappc3O55013 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trappc3O55013 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trappc3O55013 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trappc3O55013 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trappc3O55013 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trappc3O55013 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trappc3O55013 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trappc3O55013 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Trappc3O55013 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Trappc3O55013 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trappc3O55013 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trappc3O55013 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trappc3O55013 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trappc3O55013 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trappc3O55013 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trappc3O55013 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trappc3O55013 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trappc3O55013 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trappc3O55013 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trappc3O55013 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trappc3O55013 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trappc3O55013 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trappc3O55013 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trappc3O55013 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trappc3O55013 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trappc3O55013 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trappc3O55013 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trappc3O55013 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trappc3O55013 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trappc3O55013 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trappc3O55013 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trappc3O55013 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trappc3O55013 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trappc3O55013 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trappc3O55013 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trappc3O55013 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trappc3O55013 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trappc3O55013 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trappc3O55013 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trappc3O55013 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trappc3O55013 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trappc3O55013 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trappc3O55013 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trappc3O55013 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trappc3O55013 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trappc3O55013 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trappc3O55013 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trappc3O55013 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trappc3O55013 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trappc3O55013 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trappc3O55013 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trappc3O55013 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trappc3O55013 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trappc3O55013 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc3O55013 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc3O55013 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc3O55013 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc3O55013 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc3O55013 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc3O55013 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc3O55013 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc3O55013 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc3O55013 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc3O55013 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc3O55013 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc3O55013 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc3O55013 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc3O55013 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc3O55013 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc3O55013 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc3O55013 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc3O55013 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc3O55013 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc3O55013 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc3O55013 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc3O55013 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc3O55013 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc3O55013 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc3O55013 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc3O55013 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc3O55013 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc3O55013 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc3O55013 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc3O55013 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc3O55013 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc3O55013 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc3O55013 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc3O55013 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc3O55013 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc3O55013 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc3O55013 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc3O55013 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc3O55013 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc3O55013 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms