Protein–RNA interactions for Protein: O54907

Tnfsf12, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 12, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf12O54907 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfsf12O54907 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfsf12O54907 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfsf12O54907 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf12O54907 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf12O54907 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf12O54907 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf12O54907 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf12O54907 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf12O54907 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf12O54907 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf12O54907 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf12O54907 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf12O54907 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf12O54907 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf12O54907 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf12O54907 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf12O54907 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf12O54907 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf12O54907 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf12O54907 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf12O54907 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf12O54907 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf12O54907 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf12O54907 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf12O54907 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf12O54907 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf12O54907 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf12O54907 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf12O54907 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf12O54907 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf12O54907 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf12O54907 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf12O54907 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf12O54907 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf12O54907 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf12O54907 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf12O54907 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf12O54907 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf12O54907 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf12O54907 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf12O54907 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf12O54907 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf12O54907 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf12O54907 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf12O54907 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf12O54907 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf12O54907 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf12O54907 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf12O54907 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf12O54907 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf12O54907 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf12O54907 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf12O54907 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf12O54907 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf12O54907 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf12O54907 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms