Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TsksO54887 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TsksO54887 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TsksO54887 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TsksO54887 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TsksO54887 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TsksO54887 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TsksO54887 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TsksO54887 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TsksO54887 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TsksO54887 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TsksO54887 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TsksO54887 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TsksO54887 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TsksO54887 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TsksO54887 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TsksO54887 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TsksO54887 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TsksO54887 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TsksO54887 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TsksO54887 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TsksO54887 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TsksO54887 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TsksO54887 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TsksO54887 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TsksO54887 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TsksO54887 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TsksO54887 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TsksO54887 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TsksO54887 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TsksO54887 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TsksO54887 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TsksO54887 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TsksO54887 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TsksO54887 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TsksO54887 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TsksO54887 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TsksO54887 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TsksO54887 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TsksO54887 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TsksO54887 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TsksO54887 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TsksO54887 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TsksO54887 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TsksO54887 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TsksO54887 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TsksO54887 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TsksO54887 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TsksO54887 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TsksO54887 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TsksO54887 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TsksO54887 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TsksO54887 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TsksO54887 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TsksO54887 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TsksO54887 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TsksO54887 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TsksO54887 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TsksO54887 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TsksO54887 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TsksO54887 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TsksO54887 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TsksO54887 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TsksO54887 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TsksO54887 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TsksO54887 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TsksO54887 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TsksO54887 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TsksO54887 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TsksO54887 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TsksO54887 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TsksO54887 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TsksO54887 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TsksO54887 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TsksO54887 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TsksO54887 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TsksO54887 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TsksO54887 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TsksO54887 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TsksO54887 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TsksO54887 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TsksO54887 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TsksO54887 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TsksO54887 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TsksO54887 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TsksO54887 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TsksO54887 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TsksO54887 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TsksO54887 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TsksO54887 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TsksO54887 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TsksO54887 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TsksO54887 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TsksO54887 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TsksO54887 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TsksO54887 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TsksO54887 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TsksO54887 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TsksO54887 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TsksO54887 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms