Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csnk2a2O54833 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csnk2a2O54833 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csnk2a2O54833 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csnk2a2O54833 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Csnk2a2O54833 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csnk2a2O54833 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csnk2a2O54833 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Csnk2a2O54833 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csnk2a2O54833 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csnk2a2O54833 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csnk2a2O54833 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csnk2a2O54833 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csnk2a2O54833 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csnk2a2O54833 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csnk2a2O54833 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Csnk2a2O54833 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csnk2a2O54833 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csnk2a2O54833 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csnk2a2O54833 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Csnk2a2O54833 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csnk2a2O54833 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csnk2a2O54833 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csnk2a2O54833 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csnk2a2O54833 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csnk2a2O54833 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csnk2a2O54833 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csnk2a2O54833 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csnk2a2O54833 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csnk2a2O54833 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csnk2a2O54833 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csnk2a2O54833 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csnk2a2O54833 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csnk2a2O54833 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csnk2a2O54833 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csnk2a2O54833 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csnk2a2O54833 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csnk2a2O54833 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csnk2a2O54833 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csnk2a2O54833 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csnk2a2O54833 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csnk2a2O54833 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csnk2a2O54833 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csnk2a2O54833 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Csnk2a2O54833 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csnk2a2O54833 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csnk2a2O54833 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csnk2a2O54833 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csnk2a2O54833 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csnk2a2O54833 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csnk2a2O54833 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csnk2a2O54833 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csnk2a2O54833 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Csnk2a2O54833 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Csnk2a2O54833 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Csnk2a2O54833 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Csnk2a2O54833 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Csnk2a2O54833 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Csnk2a2O54833 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Csnk2a2O54833 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Csnk2a2O54833 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csnk2a2O54833 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Csnk2a2O54833 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Csnk2a2O54833 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csnk2a2O54833 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csnk2a2O54833 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csnk2a2O54833 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csnk2a2O54833 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csnk2a2O54833 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csnk2a2O54833 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csnk2a2O54833 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csnk2a2O54833 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csnk2a2O54833 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csnk2a2O54833 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Csnk2a2O54833 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csnk2a2O54833 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csnk2a2O54833 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csnk2a2O54833 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csnk2a2O54833 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csnk2a2O54833 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csnk2a2O54833 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csnk2a2O54833 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csnk2a2O54833 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csnk2a2O54833 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csnk2a2O54833 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csnk2a2O54833 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csnk2a2O54833 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csnk2a2O54833 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csnk2a2O54833 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csnk2a2O54833 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csnk2a2O54833 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csnk2a2O54833 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csnk2a2O54833 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csnk2a2O54833 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csnk2a2O54833 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csnk2a2O54833 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csnk2a2O54833 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csnk2a2O54833 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csnk2a2O54833 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csnk2a2O54833 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms