Protein–RNA interactions for Protein: O35904

Pik3cd, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3cdO35904 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pik3cdO35904 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pik3cdO35904 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pik3cdO35904 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pik3cdO35904 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pik3cdO35904 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pik3cdO35904 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Pik3cdO35904 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pik3cdO35904 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pik3cdO35904 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pik3cdO35904 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pik3cdO35904 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Pik3cdO35904 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pik3cdO35904 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pik3cdO35904 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Pik3cdO35904 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Pik3cdO35904 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pik3cdO35904 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pik3cdO35904 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pik3cdO35904 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pik3cdO35904 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pik3cdO35904 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pik3cdO35904 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pik3cdO35904 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pik3cdO35904 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pik3cdO35904 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pik3cdO35904 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pik3cdO35904 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pik3cdO35904 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pik3cdO35904 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pik3cdO35904 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pik3cdO35904 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pik3cdO35904 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Pik3cdO35904 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Pik3cdO35904 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Pik3cdO35904 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pik3cdO35904 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pik3cdO35904 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pik3cdO35904 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pik3cdO35904 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pik3cdO35904 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pik3cdO35904 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pik3cdO35904 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pik3cdO35904 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pik3cdO35904 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pik3cdO35904 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pik3cdO35904 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pik3cdO35904 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pik3cdO35904 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pik3cdO35904 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Pik3cdO35904 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pik3cdO35904 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pik3cdO35904 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pik3cdO35904 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pik3cdO35904 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pik3cdO35904 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pik3cdO35904 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pik3cdO35904 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pik3cdO35904 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pik3cdO35904 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pik3cdO35904 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pik3cdO35904 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pik3cdO35904 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pik3cdO35904 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pik3cdO35904 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pik3cdO35904 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pik3cdO35904 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pik3cdO35904 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pik3cdO35904 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pik3cdO35904 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pik3cdO35904 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pik3cdO35904 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pik3cdO35904 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pik3cdO35904 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pik3cdO35904 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pik3cdO35904 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pik3cdO35904 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pik3cdO35904 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pik3cdO35904 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pik3cdO35904 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pik3cdO35904 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pik3cdO35904 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pik3cdO35904 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pik3cdO35904 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Pik3cdO35904 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pik3cdO35904 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pik3cdO35904 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pik3cdO35904 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pik3cdO35904 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pik3cdO35904 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pik3cdO35904 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pik3cdO35904 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pik3cdO35904 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pik3cdO35904 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pik3cdO35904 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Pik3cdO35904 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pik3cdO35904 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Pik3cdO35904 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pik3cdO35904 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pik3cdO35904 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms