Protein–RNA interactions for Protein: O35347

Dgcr6, Protein DGCR6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr6O35347 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dgcr6O35347 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
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Dgcr6O35347 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dgcr6O35347 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dgcr6O35347 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dgcr6O35347 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Dgcr6O35347 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Dgcr6O35347 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dgcr6O35347 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Dgcr6O35347 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Dgcr6O35347 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Dgcr6O35347 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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Dgcr6O35347 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dgcr6O35347 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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Dgcr6O35347 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Dgcr6O35347 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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Dgcr6O35347 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dgcr6O35347 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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Dgcr6O35347 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
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Dgcr6O35347 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dgcr6O35347 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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Dgcr6O35347 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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Dgcr6O35347 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dgcr6O35347 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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Dgcr6O35347 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dgcr6O35347 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dgcr6O35347 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dgcr6O35347 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
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Dgcr6O35347 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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Dgcr6O35347 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dgcr6O35347 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dgcr6O35347 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dgcr6O35347 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Dgcr6O35347 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dgcr6O35347 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
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Dgcr6O35347 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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Dgcr6O35347 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dgcr6O35347 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dgcr6O35347 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dgcr6O35347 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dgcr6O35347 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dgcr6O35347 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dgcr6O35347 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dgcr6O35347 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dgcr6O35347 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dgcr6O35347 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dgcr6O35347 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dgcr6O35347 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dgcr6O35347 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Dgcr6O35347 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Dgcr6O35347 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
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Dgcr6O35347 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dgcr6O35347 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dgcr6O35347 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dgcr6O35347 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
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