Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Kpna3O35344 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Kpna3O35344 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Kpna3O35344 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Kpna3O35344 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Kpna3O35344 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Kpna3O35344 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Kpna3O35344 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Kpna3O35344 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Kpna3O35344 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Kpna3O35344 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Kpna3O35344 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kpna3O35344 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kpna3O35344 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kpna3O35344 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kpna3O35344 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kpna3O35344 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kpna3O35344 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kpna3O35344 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kpna3O35344 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kpna3O35344 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kpna3O35344 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Kpna3O35344 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kpna3O35344 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kpna3O35344 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kpna3O35344 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kpna3O35344 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kpna3O35344 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kpna3O35344 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kpna3O35344 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kpna3O35344 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kpna3O35344 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kpna3O35344 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kpna3O35344 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kpna3O35344 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kpna3O35344 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kpna3O35344 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kpna3O35344 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kpna3O35344 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kpna3O35344 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kpna3O35344 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kpna3O35344 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kpna3O35344 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kpna3O35344 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kpna3O35344 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kpna3O35344 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kpna3O35344 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kpna3O35344 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kpna3O35344 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kpna3O35344 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kpna3O35344 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kpna3O35344 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kpna3O35344 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kpna3O35344 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kpna3O35344 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kpna3O35344 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kpna3O35344 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kpna3O35344 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kpna3O35344 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kpna3O35344 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kpna3O35344 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kpna3O35344 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kpna3O35344 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kpna3O35344 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kpna3O35344 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kpna3O35344 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kpna3O35344 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kpna3O35344 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kpna3O35344 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kpna3O35344 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kpna3O35344 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kpna3O35344 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kpna3O35344 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kpna3O35344 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kpna3O35344 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kpna3O35344 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kpna3O35344 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kpna3O35344 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kpna3O35344 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Kpna3O35344 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kpna3O35344 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kpna3O35344 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kpna3O35344 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kpna3O35344 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kpna3O35344 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kpna3O35344 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kpna3O35344 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kpna3O35344 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kpna3O35344 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kpna3O35344 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kpna3O35344 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kpna3O35344 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kpna3O35344 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kpna3O35344 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kpna3O35344 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kpna3O35344 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kpna3O35344 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kpna3O35344 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Kpna3O35344 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Kpna3O35344 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms