Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pkd2O35245 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pkd2O35245 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pkd2O35245 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pkd2O35245 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pkd2O35245 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pkd2O35245 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pkd2O35245 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pkd2O35245 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Pkd2O35245 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pkd2O35245 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Pkd2O35245 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pkd2O35245 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pkd2O35245 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pkd2O35245 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pkd2O35245 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pkd2O35245 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pkd2O35245 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pkd2O35245 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pkd2O35245 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pkd2O35245 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pkd2O35245 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pkd2O35245 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pkd2O35245 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pkd2O35245 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pkd2O35245 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Pkd2O35245 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pkd2O35245 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pkd2O35245 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pkd2O35245 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pkd2O35245 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pkd2O35245 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pkd2O35245 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pkd2O35245 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pkd2O35245 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Pkd2O35245 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pkd2O35245 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pkd2O35245 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pkd2O35245 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Pkd2O35245 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Pkd2O35245 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Pkd2O35245 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Pkd2O35245 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pkd2O35245 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pkd2O35245 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pkd2O35245 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Pkd2O35245 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pkd2O35245 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pkd2O35245 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pkd2O35245 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pkd2O35245 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Pkd2O35245 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Pkd2O35245 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pkd2O35245 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pkd2O35245 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pkd2O35245 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pkd2O35245 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pkd2O35245 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pkd2O35245 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pkd2O35245 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pkd2O35245 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pkd2O35245 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pkd2O35245 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pkd2O35245 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pkd2O35245 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pkd2O35245 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pkd2O35245 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pkd2O35245 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pkd2O35245 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pkd2O35245 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pkd2O35245 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pkd2O35245 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pkd2O35245 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pkd2O35245 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pkd2O35245 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pkd2O35245 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pkd2O35245 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pkd2O35245 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Pkd2O35245 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pkd2O35245 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pkd2O35245 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pkd2O35245 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pkd2O35245 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pkd2O35245 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Pkd2O35245 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Pkd2O35245 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Pkd2O35245 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Pkd2O35245 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Pkd2O35245 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Pkd2O35245 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Pkd2O35245 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Pkd2O35245 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Pkd2O35245 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Pkd2O35245 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Pkd2O35245 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Pkd2O35245 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Pkd2O35245 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Pkd2O35245 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Pkd2O35245 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Pkd2O35245 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms