Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ptpn9O35239 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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Ptpn9O35239 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ptpn9O35239 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ptpn9O35239 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ptpn9O35239 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ptpn9O35239 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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Ptpn9O35239 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ptpn9O35239 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
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Ptpn9O35239 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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Ptpn9O35239 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ptpn9O35239 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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Ptpn9O35239 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms