Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bhlhe40O35185 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bhlhe40O35185 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bhlhe40O35185 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bhlhe40O35185 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bhlhe40O35185 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Bhlhe40O35185 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Bhlhe40O35185 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bhlhe40O35185 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Bhlhe40O35185 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Bhlhe40O35185 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Bhlhe40O35185 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Bhlhe40O35185 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Bhlhe40O35185 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bhlhe40O35185 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bhlhe40O35185 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bhlhe40O35185 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bhlhe40O35185 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bhlhe40O35185 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bhlhe40O35185 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Bhlhe40O35185 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bhlhe40O35185 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bhlhe40O35185 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bhlhe40O35185 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Bhlhe40O35185 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bhlhe40O35185 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bhlhe40O35185 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bhlhe40O35185 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bhlhe40O35185 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bhlhe40O35185 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bhlhe40O35185 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bhlhe40O35185 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bhlhe40O35185 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bhlhe40O35185 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bhlhe40O35185 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bhlhe40O35185 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bhlhe40O35185 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bhlhe40O35185 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bhlhe40O35185 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bhlhe40O35185 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bhlhe40O35185 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bhlhe40O35185 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bhlhe40O35185 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bhlhe40O35185 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bhlhe40O35185 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bhlhe40O35185 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bhlhe40O35185 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bhlhe40O35185 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bhlhe40O35185 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bhlhe40O35185 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bhlhe40O35185 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bhlhe40O35185 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Bhlhe40O35185 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bhlhe40O35185 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bhlhe40O35185 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Bhlhe40O35185 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bhlhe40O35185 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bhlhe40O35185 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bhlhe40O35185 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bhlhe40O35185 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bhlhe40O35185 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bhlhe40O35185 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bhlhe40O35185 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bhlhe40O35185 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bhlhe40O35185 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Bhlhe40O35185 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bhlhe40O35185 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bhlhe40O35185 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bhlhe40O35185 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bhlhe40O35185 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bhlhe40O35185 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bhlhe40O35185 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bhlhe40O35185 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bhlhe40O35185 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bhlhe40O35185 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bhlhe40O35185 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bhlhe40O35185 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bhlhe40O35185 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bhlhe40O35185 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bhlhe40O35185 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bhlhe40O35185 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bhlhe40O35185 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bhlhe40O35185 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Bhlhe40O35185 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bhlhe40O35185 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bhlhe40O35185 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bhlhe40O35185 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bhlhe40O35185 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Bhlhe40O35185 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bhlhe40O35185 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bhlhe40O35185 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bhlhe40O35185 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bhlhe40O35185 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bhlhe40O35185 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bhlhe40O35185 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bhlhe40O35185 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bhlhe40O35185 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bhlhe40O35185 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bhlhe40O35185 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bhlhe40O35185 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms