Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smad6O35182 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smad6O35182 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smad6O35182 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smad6O35182 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smad6O35182 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smad6O35182 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smad6O35182 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smad6O35182 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smad6O35182 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smad6O35182 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smad6O35182 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smad6O35182 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Smad6O35182 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smad6O35182 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smad6O35182 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smad6O35182 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smad6O35182 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smad6O35182 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smad6O35182 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Smad6O35182 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Smad6O35182 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smad6O35182 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smad6O35182 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smad6O35182 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Smad6O35182 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smad6O35182 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smad6O35182 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smad6O35182 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Smad6O35182 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smad6O35182 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smad6O35182 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smad6O35182 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smad6O35182 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smad6O35182 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smad6O35182 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smad6O35182 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smad6O35182 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smad6O35182 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smad6O35182 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smad6O35182 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smad6O35182 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smad6O35182 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smad6O35182 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smad6O35182 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smad6O35182 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smad6O35182 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smad6O35182 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smad6O35182 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smad6O35182 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smad6O35182 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smad6O35182 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smad6O35182 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smad6O35182 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smad6O35182 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smad6O35182 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smad6O35182 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smad6O35182 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Smad6O35182 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smad6O35182 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smad6O35182 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smad6O35182 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smad6O35182 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smad6O35182 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smad6O35182 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smad6O35182 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smad6O35182 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smad6O35182 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smad6O35182 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Smad6O35182 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smad6O35182 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smad6O35182 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smad6O35182 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smad6O35182 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smad6O35182 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smad6O35182 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smad6O35182 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smad6O35182 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smad6O35182 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smad6O35182 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smad6O35182 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smad6O35182 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smad6O35182 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smad6O35182 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Smad6O35182 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smad6O35182 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smad6O35182 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Smad6O35182 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Smad6O35182 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smad6O35182 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smad6O35182 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Smad6O35182 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smad6O35182 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smad6O35182 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smad6O35182 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smad6O35182 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smad6O35182 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smad6O35182 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smad6O35182 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smad6O35182 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms