Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nedd9O35177 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nedd9O35177 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nedd9O35177 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nedd9O35177 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nedd9O35177 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nedd9O35177 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nedd9O35177 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nedd9O35177 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nedd9O35177 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nedd9O35177 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nedd9O35177 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nedd9O35177 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nedd9O35177 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nedd9O35177 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nedd9O35177 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nedd9O35177 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nedd9O35177 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nedd9O35177 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nedd9O35177 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nedd9O35177 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nedd9O35177 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nedd9O35177 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nedd9O35177 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nedd9O35177 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nedd9O35177 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nedd9O35177 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nedd9O35177 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nedd9O35177 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nedd9O35177 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nedd9O35177 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nedd9O35177 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nedd9O35177 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nedd9O35177 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nedd9O35177 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nedd9O35177 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nedd9O35177 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nedd9O35177 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nedd9O35177 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nedd9O35177 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nedd9O35177 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nedd9O35177 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nedd9O35177 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nedd9O35177 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nedd9O35177 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nedd9O35177 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nedd9O35177 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nedd9O35177 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nedd9O35177 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nedd9O35177 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nedd9O35177 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nedd9O35177 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nedd9O35177 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nedd9O35177 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nedd9O35177 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nedd9O35177 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nedd9O35177 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nedd9O35177 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nedd9O35177 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nedd9O35177 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nedd9O35177 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nedd9O35177 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nedd9O35177 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nedd9O35177 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nedd9O35177 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nedd9O35177 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nedd9O35177 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nedd9O35177 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nedd9O35177 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nedd9O35177 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nedd9O35177 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nedd9O35177 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nedd9O35177 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Nedd9O35177 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nedd9O35177 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nedd9O35177 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nedd9O35177 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nedd9O35177 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nedd9O35177 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nedd9O35177 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nedd9O35177 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nedd9O35177 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nedd9O35177 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nedd9O35177 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nedd9O35177 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nedd9O35177 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nedd9O35177 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nedd9O35177 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nedd9O35177 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nedd9O35177 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nedd9O35177 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nedd9O35177 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nedd9O35177 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nedd9O35177 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nedd9O35177 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nedd9O35177 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nedd9O35177 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nedd9O35177 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nedd9O35177 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nedd9O35177 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms