Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Polr1aO35134 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Polr1aO35134 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Polr1aO35134 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Polr1aO35134 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Polr1aO35134 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Polr1aO35134 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Polr1aO35134 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Polr1aO35134 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Polr1aO35134 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Polr1aO35134 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Polr1aO35134 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Polr1aO35134 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Polr1aO35134 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Polr1aO35134 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Polr1aO35134 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Polr1aO35134 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Polr1aO35134 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Polr1aO35134 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Polr1aO35134 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Polr1aO35134 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Polr1aO35134 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Polr1aO35134 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Polr1aO35134 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Polr1aO35134 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
Polr1aO35134 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Polr1aO35134 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Polr1aO35134 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Polr1aO35134 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Polr1aO35134 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Polr1aO35134 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Polr1aO35134 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Polr1aO35134 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Polr1aO35134 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Polr1aO35134 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Polr1aO35134 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Polr1aO35134 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Polr1aO35134 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Polr1aO35134 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Polr1aO35134 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Polr1aO35134 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Polr1aO35134 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Polr1aO35134 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Polr1aO35134 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Polr1aO35134 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Polr1aO35134 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Polr1aO35134 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Polr1aO35134 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Polr1aO35134 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Polr1aO35134 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Polr1aO35134 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Polr1aO35134 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Polr1aO35134 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Polr1aO35134 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Polr1aO35134 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Polr1aO35134 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Polr1aO35134 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Polr1aO35134 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Polr1aO35134 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Polr1aO35134 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Polr1aO35134 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Polr1aO35134 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Polr1aO35134 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Polr1aO35134 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Polr1aO35134 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Polr1aO35134 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Polr1aO35134 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Polr1aO35134 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Polr1aO35134 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Polr1aO35134 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Polr1aO35134 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Polr1aO35134 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Polr1aO35134 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Polr1aO35134 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Polr1aO35134 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Polr1aO35134 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Polr1aO35134 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Polr1aO35134 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Polr1aO35134 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Polr1aO35134 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Polr1aO35134 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Polr1aO35134 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Polr1aO35134 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Polr1aO35134 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Polr1aO35134 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Polr1aO35134 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Polr1aO35134 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Polr1aO35134 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Polr1aO35134 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Polr1aO35134 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Polr1aO35134 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Polr1aO35134 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Polr1aO35134 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Polr1aO35134 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Polr1aO35134 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Polr1aO35134 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Polr1aO35134 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Polr1aO35134 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Polr1aO35134 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Polr1aO35134 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms