Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cldn4O35054 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cldn4O35054 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cldn4O35054 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cldn4O35054 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cldn4O35054 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Cldn4O35054 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cldn4O35054 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cldn4O35054 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cldn4O35054 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cldn4O35054 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cldn4O35054 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cldn4O35054 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cldn4O35054 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cldn4O35054 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cldn4O35054 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cldn4O35054 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Cldn4O35054 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Cldn4O35054 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Cldn4O35054 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cldn4O35054 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Cldn4O35054 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Cldn4O35054 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Cldn4O35054 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Cldn4O35054 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Cldn4O35054 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cldn4O35054 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cldn4O35054 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Cldn4O35054 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cldn4O35054 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cldn4O35054 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cldn4O35054 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cldn4O35054 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cldn4O35054 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cldn4O35054 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cldn4O35054 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cldn4O35054 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cldn4O35054 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Cldn4O35054 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Cldn4O35054 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cldn4O35054 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cldn4O35054 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cldn4O35054 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cldn4O35054 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cldn4O35054 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cldn4O35054 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cldn4O35054 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Cldn4O35054 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cldn4O35054 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cldn4O35054 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cldn4O35054 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cldn4O35054 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cldn4O35054 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cldn4O35054 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cldn4O35054 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cldn4O35054 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Cldn4O35054 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cldn4O35054 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cldn4O35054 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cldn4O35054 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cldn4O35054 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cldn4O35054 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cldn4O35054 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cldn4O35054 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cldn4O35054 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cldn4O35054 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Cldn4O35054 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cldn4O35054 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cldn4O35054 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cldn4O35054 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cldn4O35054 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cldn4O35054 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cldn4O35054 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cldn4O35054 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cldn4O35054 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cldn4O35054 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cldn4O35054 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cldn4O35054 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cldn4O35054 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cldn4O35054 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cldn4O35054 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cldn4O35054 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cldn4O35054 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cldn4O35054 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cldn4O35054 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cldn4O35054 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cldn4O35054 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cldn4O35054 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cldn4O35054 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cldn4O35054 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cldn4O35054 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cldn4O35054 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cldn4O35054 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cldn4O35054 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cldn4O35054 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cldn4O35054 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cldn4O35054 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cldn4O35054 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cldn4O35054 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cldn4O35054 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
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