Protein–RNA interactions for Protein: O08788

Dctn1, Dynactin subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn1O08788 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Dctn1O08788 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dctn1O08788 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dctn1O08788 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dctn1O08788 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dctn1O08788 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dctn1O08788 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dctn1O08788 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dctn1O08788 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dctn1O08788 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dctn1O08788 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Dctn1O08788 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Dctn1O08788 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Dctn1O08788 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Dctn1O08788 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Dctn1O08788 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Dctn1O08788 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Dctn1O08788 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Dctn1O08788 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Dctn1O08788 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dctn1O08788 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dctn1O08788 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dctn1O08788 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dctn1O08788 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Dctn1O08788 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dctn1O08788 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dctn1O08788 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dctn1O08788 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dctn1O08788 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dctn1O08788 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dctn1O08788 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dctn1O08788 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dctn1O08788 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dctn1O08788 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dctn1O08788 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dctn1O08788 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Dctn1O08788 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dctn1O08788 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dctn1O08788 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dctn1O08788 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dctn1O08788 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dctn1O08788 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dctn1O08788 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dctn1O08788 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dctn1O08788 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dctn1O08788 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dctn1O08788 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dctn1O08788 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dctn1O08788 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dctn1O08788 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Dctn1O08788 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dctn1O08788 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dctn1O08788 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dctn1O08788 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dctn1O08788 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dctn1O08788 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dctn1O08788 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dctn1O08788 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Dctn1O08788 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dctn1O08788 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dctn1O08788 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Dctn1O08788 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dctn1O08788 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dctn1O08788 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dctn1O08788 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dctn1O08788 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dctn1O08788 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dctn1O08788 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dctn1O08788 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dctn1O08788 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Dctn1O08788 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Dctn1O08788 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Dctn1O08788 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Dctn1O08788 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Dctn1O08788 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Dctn1O08788 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Dctn1O08788 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Dctn1O08788 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Dctn1O08788 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Dctn1O08788 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Dctn1O08788 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Dctn1O08788 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Dctn1O08788 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Dctn1O08788 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Dctn1O08788 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Dctn1O08788 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Dctn1O08788 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Dctn1O08788 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Dctn1O08788 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Dctn1O08788 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Dctn1O08788 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Dctn1O08788 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Dctn1O08788 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Dctn1O08788 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Dctn1O08788 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Dctn1O08788 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Dctn1O08788 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Dctn1O08788 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Dctn1O08788 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Dctn1O08788 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms