Protein–RNA interactions for Protein: O08786

Cckar, Cholecystokinin receptor type A, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckarO08786 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CckarO08786 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CckarO08786 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CckarO08786 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CckarO08786 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CckarO08786 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CckarO08786 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CckarO08786 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CckarO08786 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CckarO08786 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CckarO08786 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CckarO08786 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CckarO08786 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CckarO08786 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CckarO08786 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CckarO08786 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CckarO08786 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CckarO08786 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CckarO08786 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CckarO08786 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CckarO08786 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CckarO08786 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CckarO08786 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CckarO08786 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CckarO08786 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CckarO08786 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CckarO08786 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CckarO08786 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CckarO08786 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CckarO08786 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CckarO08786 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CckarO08786 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CckarO08786 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CckarO08786 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CckarO08786 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CckarO08786 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CckarO08786 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CckarO08786 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CckarO08786 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CckarO08786 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CckarO08786 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CckarO08786 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CckarO08786 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CckarO08786 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CckarO08786 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CckarO08786 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CckarO08786 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CckarO08786 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CckarO08786 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CckarO08786 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CckarO08786 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CckarO08786 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CckarO08786 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CckarO08786 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CckarO08786 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CckarO08786 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CckarO08786 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CckarO08786 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CckarO08786 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CckarO08786 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CckarO08786 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CckarO08786 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CckarO08786 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CckarO08786 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CckarO08786 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CckarO08786 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CckarO08786 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CckarO08786 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CckarO08786 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CckarO08786 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CckarO08786 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CckarO08786 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CckarO08786 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CckarO08786 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CckarO08786 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CckarO08786 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CckarO08786 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CckarO08786 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CckarO08786 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CckarO08786 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CckarO08786 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CckarO08786 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CckarO08786 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CckarO08786 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CckarO08786 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CckarO08786 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CckarO08786 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CckarO08786 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CckarO08786 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CckarO08786 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CckarO08786 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CckarO08786 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CckarO08786 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CckarO08786 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CckarO08786 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CckarO08786 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CckarO08786 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CckarO08786 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CckarO08786 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CckarO08786 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms