Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sec22bO08547 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sec22bO08547 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sec22bO08547 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sec22bO08547 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sec22bO08547 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sec22bO08547 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sec22bO08547 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sec22bO08547 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sec22bO08547 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sec22bO08547 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sec22bO08547 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sec22bO08547 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sec22bO08547 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sec22bO08547 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Sec22bO08547 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sec22bO08547 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sec22bO08547 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sec22bO08547 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sec22bO08547 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sec22bO08547 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sec22bO08547 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sec22bO08547 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sec22bO08547 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Sec22bO08547 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sec22bO08547 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sec22bO08547 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Sec22bO08547 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sec22bO08547 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sec22bO08547 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sec22bO08547 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sec22bO08547 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sec22bO08547 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sec22bO08547 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sec22bO08547 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sec22bO08547 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sec22bO08547 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sec22bO08547 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Sec22bO08547 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sec22bO08547 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sec22bO08547 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sec22bO08547 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sec22bO08547 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sec22bO08547 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sec22bO08547 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sec22bO08547 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Sec22bO08547 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sec22bO08547 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sec22bO08547 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Sec22bO08547 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sec22bO08547 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sec22bO08547 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sec22bO08547 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sec22bO08547 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sec22bO08547 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sec22bO08547 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sec22bO08547 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sec22bO08547 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sec22bO08547 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Sec22bO08547 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sec22bO08547 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sec22bO08547 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sec22bO08547 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sec22bO08547 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sec22bO08547 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sec22bO08547 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sec22bO08547 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sec22bO08547 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sec22bO08547 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sec22bO08547 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sec22bO08547 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sec22bO08547 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sec22bO08547 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sec22bO08547 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sec22bO08547 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sec22bO08547 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sec22bO08547 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sec22bO08547 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sec22bO08547 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sec22bO08547 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sec22bO08547 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Sec22bO08547 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sec22bO08547 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sec22bO08547 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sec22bO08547 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sec22bO08547 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sec22bO08547 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sec22bO08547 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sec22bO08547 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sec22bO08547 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sec22bO08547 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sec22bO08547 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sec22bO08547 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Sec22bO08547 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sec22bO08547 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Sec22bO08547 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sec22bO08547 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sec22bO08547 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sec22bO08547 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sec22bO08547 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms