Protein–RNA interactions for Protein: O08546

U90926, Putative TNF-resistance related protein, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U90926O08546 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
U90926O08546 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
U90926O08546 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
U90926O08546 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
U90926O08546 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
U90926O08546 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
U90926O08546 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
U90926O08546 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
U90926O08546 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
U90926O08546 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
U90926O08546 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
U90926O08546 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
U90926O08546 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
U90926O08546 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
U90926O08546 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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U90926O08546 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
U90926O08546 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
U90926O08546 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
U90926O08546 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
U90926O08546 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
U90926O08546 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
U90926O08546 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
U90926O08546 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
U90926O08546 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
U90926O08546 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
U90926O08546 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
U90926O08546 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
U90926O08546 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
U90926O08546 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
U90926O08546 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
U90926O08546 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
U90926O08546 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
U90926O08546 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
U90926O08546 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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U90926O08546 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
U90926O08546 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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U90926O08546 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
U90926O08546 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
U90926O08546 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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U90926O08546 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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U90926O08546 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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U90926O08546 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
U90926O08546 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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U90926O08546 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
U90926O08546 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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U90926O08546 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
U90926O08546 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
U90926O08546 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
U90926O08546 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
U90926O08546 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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U90926O08546 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
U90926O08546 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
U90926O08546 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
U90926O08546 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
U90926O08546 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
U90926O08546 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
U90926O08546 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
U90926O08546 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
U90926O08546 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
U90926O08546 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
U90926O08546 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
U90926O08546 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
U90926O08546 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
U90926O08546 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
U90926O08546 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
U90926O08546 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
U90926O08546 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
U90926O08546 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
U90926O08546 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
U90926O08546 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
U90926O08546 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
U90926O08546 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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