Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp35M0QWN7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp35M0QWN7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp35M0QWN7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp35M0QWN7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp35M0QWN7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp35M0QWN7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp35M0QWN7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp35M0QWN7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp35M0QWN7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp35M0QWN7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp35M0QWN7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp35M0QWN7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp35M0QWN7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp35M0QWN7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp35M0QWN7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp35M0QWN7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp35M0QWN7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp35M0QWN7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp35M0QWN7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp35M0QWN7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp35M0QWN7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp35M0QWN7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp35M0QWN7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp35M0QWN7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp35M0QWN7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp35M0QWN7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp35M0QWN7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp35M0QWN7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp35M0QWN7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp35M0QWN7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp35M0QWN7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp35M0QWN7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp35M0QWN7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp35M0QWN7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp35M0QWN7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp35M0QWN7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
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Usp35M0QWN7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp35M0QWN7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp35M0QWN7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp35M0QWN7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp35M0QWN7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp35M0QWN7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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Usp35M0QWN7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp35M0QWN7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp35M0QWN7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp35M0QWN7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp35M0QWN7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp35M0QWN7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp35M0QWN7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp35M0QWN7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp35M0QWN7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp35M0QWN7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp35M0QWN7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp35M0QWN7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp35M0QWN7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp35M0QWN7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp35M0QWN7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp35M0QWN7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
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Usp35M0QWN7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
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Usp35M0QWN7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp35M0QWN7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp35M0QWN7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp35M0QWN7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp35M0QWN7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp35M0QWN7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp35M0QWN7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp35M0QWN7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp35M0QWN7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp35M0QWN7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp35M0QWN7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp35M0QWN7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp35M0QWN7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp35M0QWN7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp35M0QWN7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp35M0QWN7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp35M0QWN7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp35M0QWN7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp35M0QWN7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp35M0QWN7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp35M0QWN7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp35M0QWN7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp35M0QWN7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp35M0QWN7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp35M0QWN7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp35M0QWN7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp35M0QWN7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp35M0QWN7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp35M0QWN7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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