Protein–RNA interactions for Protein: L7N248

Gm6871, Predicted gene 6871, mousemouse

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Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6871L7N248 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6871L7N248 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6871L7N248 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6871L7N248 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6871L7N248 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6871L7N248 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6871L7N248 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm6871L7N248 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm6871L7N248 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm6871L7N248 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm6871L7N248 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6871L7N248 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6871L7N248 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6871L7N248 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6871L7N248 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6871L7N248 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6871L7N248 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6871L7N248 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6871L7N248 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6871L7N248 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6871L7N248 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6871L7N248 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6871L7N248 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6871L7N248 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6871L7N248 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6871L7N248 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6871L7N248 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6871L7N248 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6871L7N248 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6871L7N248 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6871L7N248 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6871L7N248 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6871L7N248 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6871L7N248 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6871L7N248 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6871L7N248 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6871L7N248 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6871L7N248 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6871L7N248 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6871L7N248 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6871L7N248 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6871L7N248 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6871L7N248 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6871L7N248 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6871L7N248 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6871L7N248 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6871L7N248 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6871L7N248 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6871L7N248 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6871L7N248 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6871L7N248 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6871L7N248 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6871L7N248 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6871L7N248 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6871L7N248 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6871L7N248 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6871L7N248 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6871L7N248 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6871L7N248 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6871L7N248 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6871L7N248 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6871L7N248 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6871L7N248 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6871L7N248 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6871L7N248 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6871L7N248 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6871L7N248 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6871L7N248 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6871L7N248 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6871L7N248 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6871L7N248 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6871L7N248 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6871L7N248 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6871L7N248 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6871L7N248 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6871L7N248 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6871L7N248 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6871L7N248 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6871L7N248 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6871L7N248 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6871L7N248 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6871L7N248 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6871L7N248 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6871L7N248 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6871L7N248 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6871L7N248 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6871L7N248 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6871L7N248 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6871L7N248 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6871L7N248 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6871L7N248 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6871L7N248 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6871L7N248 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6871L7N248 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6871L7N248 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6871L7N248 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6871L7N248 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6871L7N248 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6871L7N248 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6871L7N248 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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