Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20878L7N244 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20878L7N244 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20878L7N244 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20878L7N244 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20878L7N244 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20878L7N244 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20878L7N244 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm20878L7N244 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20878L7N244 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20878L7N244 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20878L7N244 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20878L7N244 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20878L7N244 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20878L7N244 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20878L7N244 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20878L7N244 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20878L7N244 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20878L7N244 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20878L7N244 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20878L7N244 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20878L7N244 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20878L7N244 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20878L7N244 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20878L7N244 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20878L7N244 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20878L7N244 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20878L7N244 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20878L7N244 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20878L7N244 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20878L7N244 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20878L7N244 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20878L7N244 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20878L7N244 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20878L7N244 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20878L7N244 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20878L7N244 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20878L7N244 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20878L7N244 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20878L7N244 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20878L7N244 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20878L7N244 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20878L7N244 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20878L7N244 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20878L7N244 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20878L7N244 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20878L7N244 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20878L7N244 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20878L7N244 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20878L7N244 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20878L7N244 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20878L7N244 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20878L7N244 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20878L7N244 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20878L7N244 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20878L7N244 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20878L7N244 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20878L7N244 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20878L7N244 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20878L7N244 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20878L7N244 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20878L7N244 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20878L7N244 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20878L7N244 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20878L7N244 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20878L7N244 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20878L7N244 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20878L7N244 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20878L7N244 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20878L7N244 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20878L7N244 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20878L7N244 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20878L7N244 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20878L7N244 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20878L7N244 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gm20878L7N244 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20878L7N244 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20878L7N244 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20878L7N244 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20878L7N244 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20878L7N244 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20878L7N244 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20878L7N244 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20878L7N244 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20878L7N244 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20878L7N244 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20878L7N244 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20878L7N244 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20878L7N244 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20878L7N244 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20878L7N244 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20878L7N244 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20878L7N244 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20878L7N244 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20878L7N244 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20878L7N244 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20878L7N244 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20878L7N244 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20878L7N244 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20878L7N244 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms