Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ23

Gm21310, Predicted gene, 21310, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21310J3QQ23 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21310J3QQ23 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21310J3QQ23 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21310J3QQ23 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21310J3QQ23 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21310J3QQ23 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21310J3QQ23 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21310J3QQ23 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21310J3QQ23 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21310J3QQ23 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21310J3QQ23 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21310J3QQ23 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21310J3QQ23 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21310J3QQ23 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21310J3QQ23 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21310J3QQ23 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21310J3QQ23 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21310J3QQ23 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21310J3QQ23 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21310J3QQ23 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21310J3QQ23 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21310J3QQ23 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21310J3QQ23 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21310J3QQ23 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21310J3QQ23 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21310J3QQ23 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21310J3QQ23 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21310J3QQ23 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21310J3QQ23 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21310J3QQ23 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21310J3QQ23 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21310J3QQ23 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21310J3QQ23 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21310J3QQ23 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21310J3QQ23 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21310J3QQ23 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21310J3QQ23 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21310J3QQ23 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21310J3QQ23 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21310J3QQ23 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21310J3QQ23 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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