Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm2035J3QP87 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm2035J3QP87 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm2035J3QP87 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm2035J3QP87 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm2035J3QP87 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm2035J3QP87 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm2035J3QP87 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm2035J3QP87 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm2035J3QP87 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gm2035J3QP87 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gm2035J3QP87 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gm2035J3QP87 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm2035J3QP87 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm2035J3QP87 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm2035J3QP87 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm2035J3QP87 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm2035J3QP87 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm2035J3QP87 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm2035J3QP87 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm2035J3QP87 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm2035J3QP87 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm2035J3QP87 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm2035J3QP87 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm2035J3QP87 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm2035J3QP87 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm2035J3QP87 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm2035J3QP87 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm2035J3QP87 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm2035J3QP87 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm2035J3QP87 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm2035J3QP87 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm2035J3QP87 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm2035J3QP87 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm2035J3QP87 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm2035J3QP87 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm2035J3QP87 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm2035J3QP87 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm2035J3QP87 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm2035J3QP87 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm2035J3QP87 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm2035J3QP87 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm2035J3QP87 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm2035J3QP87 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm2035J3QP87 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm2035J3QP87 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm2035J3QP87 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm2035J3QP87 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm2035J3QP87 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm2035J3QP87 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm2035J3QP87 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm2035J3QP87 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm2035J3QP87 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm2035J3QP87 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm2035J3QP87 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm2035J3QP87 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm2035J3QP87 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm2035J3QP87 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm2035J3QP87 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm2035J3QP87 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm2035J3QP87 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm2035J3QP87 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm2035J3QP87 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm2035J3QP87 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm2035J3QP87 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm2035J3QP87 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm2035J3QP87 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm2035J3QP87 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm2035J3QP87 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm2035J3QP87 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm2035J3QP87 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm2035J3QP87 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm2035J3QP87 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm2035J3QP87 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm2035J3QP87 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm2035J3QP87 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm2035J3QP87 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm2035J3QP87 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm2035J3QP87 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm2035J3QP87 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm2035J3QP87 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm2035J3QP87 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm2035J3QP87 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm2035J3QP87 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm2035J3QP87 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm2035J3QP87 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm2035J3QP87 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm2035J3QP87 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm2035J3QP87 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm2035J3QP87 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm2035J3QP87 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm2035J3QP87 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm2035J3QP87 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm2035J3QP87 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm2035J3QP87 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm2035J3QP87 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm2035J3QP87 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm2035J3QP87 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm2035J3QP87 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm2035J3QP87 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms