Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20918J3QN17 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20918J3QN17 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20918J3QN17 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20918J3QN17 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20918J3QN17 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20918J3QN17 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20918J3QN17 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20918J3QN17 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20918J3QN17 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20918J3QN17 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20918J3QN17 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20918J3QN17 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20918J3QN17 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20918J3QN17 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20918J3QN17 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20918J3QN17 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20918J3QN17 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20918J3QN17 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20918J3QN17 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20918J3QN17 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20918J3QN17 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20918J3QN17 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20918J3QN17 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms