Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm3415J3QMS8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm3415J3QMS8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm3415J3QMS8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm3415J3QMS8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm3415J3QMS8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm3415J3QMS8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm3415J3QMS8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm3415J3QMS8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm3415J3QMS8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm3415J3QMS8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm3415J3QMS8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm3415J3QMS8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm3415J3QMS8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm3415J3QMS8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm3415J3QMS8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm3415J3QMS8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm3415J3QMS8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm3415J3QMS8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm3415J3QMS8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gm3415J3QMS8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gm3415J3QMS8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm3415J3QMS8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm3415J3QMS8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm3415J3QMS8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm3415J3QMS8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm3415J3QMS8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm3415J3QMS8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm3415J3QMS8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm3415J3QMS8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm3415J3QMS8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm3415J3QMS8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm3415J3QMS8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm3415J3QMS8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm3415J3QMS8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm3415J3QMS8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm3415J3QMS8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm3415J3QMS8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm3415J3QMS8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm3415J3QMS8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm3415J3QMS8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm3415J3QMS8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm3415J3QMS8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm3415J3QMS8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm3415J3QMS8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm3415J3QMS8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm3415J3QMS8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm3415J3QMS8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3415J3QMS8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3415J3QMS8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3415J3QMS8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3415J3QMS8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3415J3QMS8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3415J3QMS8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3415J3QMS8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3415J3QMS8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3415J3QMS8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3415J3QMS8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm3415J3QMS8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm3415J3QMS8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm3415J3QMS8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm3415J3QMS8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm3415J3QMS8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm3415J3QMS8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm3415J3QMS8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm3415J3QMS8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm3415J3QMS8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm3415J3QMS8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm3415J3QMS8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm3415J3QMS8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm3415J3QMS8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm3415J3QMS8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm3415J3QMS8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm3415J3QMS8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm3415J3QMS8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm3415J3QMS8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm3415J3QMS8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm3415J3QMS8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm3415J3QMS8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm3415J3QMS8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm3415J3QMS8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm3415J3QMS8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm3415J3QMS8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm3415J3QMS8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm3415J3QMS8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm3415J3QMS8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm3415J3QMS8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm3415J3QMS8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm3415J3QMS8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm3415J3QMS8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3415J3QMS8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3415J3QMS8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3415J3QMS8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3415J3QMS8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3415J3QMS8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3415J3QMS8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3415J3QMS8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3415J3QMS8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3415J3QMS8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3415J3QMS8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
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