Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS2

1700014D04Rik, MCG148436, mousemouse

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700014D04RikJ3QMS2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700014D04RikJ3QMS2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700014D04RikJ3QMS2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700014D04RikJ3QMS2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700014D04RikJ3QMS2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700014D04RikJ3QMS2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700014D04RikJ3QMS2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700014D04RikJ3QMS2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
1700014D04RikJ3QMS2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700014D04RikJ3QMS2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700014D04RikJ3QMS2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700014D04RikJ3QMS2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700014D04RikJ3QMS2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700014D04RikJ3QMS2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700014D04RikJ3QMS2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700014D04RikJ3QMS2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700014D04RikJ3QMS2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700014D04RikJ3QMS2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700014D04RikJ3QMS2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
1700014D04RikJ3QMS2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700014D04RikJ3QMS2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700014D04RikJ3QMS2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700014D04RikJ3QMS2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700014D04RikJ3QMS2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700014D04RikJ3QMS2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
1700014D04RikJ3QMS2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700014D04RikJ3QMS2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700014D04RikJ3QMS2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700014D04RikJ3QMS2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700014D04RikJ3QMS2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700014D04RikJ3QMS2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700014D04RikJ3QMS2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700014D04RikJ3QMS2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
1700014D04RikJ3QMS2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700014D04RikJ3QMS2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700014D04RikJ3QMS2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700014D04RikJ3QMS2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700014D04RikJ3QMS2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700014D04RikJ3QMS2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700014D04RikJ3QMS2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700014D04RikJ3QMS2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700014D04RikJ3QMS2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700014D04RikJ3QMS2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700014D04RikJ3QMS2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700014D04RikJ3QMS2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700014D04RikJ3QMS2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700014D04RikJ3QMS2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
1700014D04RikJ3QMS2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700014D04RikJ3QMS2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700014D04RikJ3QMS2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700014D04RikJ3QMS2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700014D04RikJ3QMS2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700014D04RikJ3QMS2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700014D04RikJ3QMS2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700014D04RikJ3QMS2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700014D04RikJ3QMS2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700014D04RikJ3QMS2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700014D04RikJ3QMS2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700014D04RikJ3QMS2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700014D04RikJ3QMS2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700014D04RikJ3QMS2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700014D04RikJ3QMS2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700014D04RikJ3QMS2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700014D04RikJ3QMS2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
1700014D04RikJ3QMS2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700014D04RikJ3QMS2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700014D04RikJ3QMS2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
1700014D04RikJ3QMS2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700014D04RikJ3QMS2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700014D04RikJ3QMS2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700014D04RikJ3QMS2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700014D04RikJ3QMS2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700014D04RikJ3QMS2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700014D04RikJ3QMS2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700014D04RikJ3QMS2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700014D04RikJ3QMS2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700014D04RikJ3QMS2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700014D04RikJ3QMS2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700014D04RikJ3QMS2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700014D04RikJ3QMS2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700014D04RikJ3QMS2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
1700014D04RikJ3QMS2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700014D04RikJ3QMS2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
1700014D04RikJ3QMS2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700014D04RikJ3QMS2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700014D04RikJ3QMS2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700014D04RikJ3QMS2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700014D04RikJ3QMS2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700014D04RikJ3QMS2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700014D04RikJ3QMS2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700014D04RikJ3QMS2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700014D04RikJ3QMS2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700014D04RikJ3QMS2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700014D04RikJ3QMS2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700014D04RikJ3QMS2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700014D04RikJ3QMS2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
1700014D04RikJ3QMS2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
1700014D04RikJ3QMS2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700014D04RikJ3QMS2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700014D04RikJ3QMS2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms