Protein–RNA interactions for Protein: J3QJZ1

Gm21969, Predicted gene 21969, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21969J3QJZ1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm21969J3QJZ1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm21969J3QJZ1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm21969J3QJZ1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm21969J3QJZ1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm21969J3QJZ1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm21969J3QJZ1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm21969J3QJZ1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm21969J3QJZ1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm21969J3QJZ1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm21969J3QJZ1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm21969J3QJZ1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm21969J3QJZ1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm21969J3QJZ1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm21969J3QJZ1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm21969J3QJZ1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm21969J3QJZ1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm21969J3QJZ1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm21969J3QJZ1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm21969J3QJZ1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm21969J3QJZ1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm21969J3QJZ1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm21969J3QJZ1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm21969J3QJZ1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm21969J3QJZ1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm21969J3QJZ1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm21969J3QJZ1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm21969J3QJZ1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm21969J3QJZ1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm21969J3QJZ1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm21969J3QJZ1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm21969J3QJZ1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm21969J3QJZ1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm21969J3QJZ1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm21969J3QJZ1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm21969J3QJZ1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm21969J3QJZ1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gm21969J3QJZ1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gm21969J3QJZ1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm21969J3QJZ1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm21969J3QJZ1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm21969J3QJZ1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm21969J3QJZ1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm21969J3QJZ1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm21969J3QJZ1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm21969J3QJZ1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm21969J3QJZ1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm21969J3QJZ1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm21969J3QJZ1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm21969J3QJZ1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm21969J3QJZ1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Gm21969J3QJZ1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm21969J3QJZ1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm21969J3QJZ1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm21969J3QJZ1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm21969J3QJZ1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm21969J3QJZ1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm21969J3QJZ1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm21969J3QJZ1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm21969J3QJZ1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm21969J3QJZ1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm21969J3QJZ1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm21969J3QJZ1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm21969J3QJZ1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm21969J3QJZ1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm21969J3QJZ1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm21969J3QJZ1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm21969J3QJZ1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm21969J3QJZ1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm21969J3QJZ1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm21969J3QJZ1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm21969J3QJZ1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm21969J3QJZ1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm21969J3QJZ1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm21969J3QJZ1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm21969J3QJZ1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm21969J3QJZ1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm21969J3QJZ1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm21969J3QJZ1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm21969J3QJZ1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm21969J3QJZ1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm21969J3QJZ1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm21969J3QJZ1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm21969J3QJZ1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm21969J3QJZ1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm21969J3QJZ1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm21969J3QJZ1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm21969J3QJZ1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm21969J3QJZ1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm21969J3QJZ1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm21969J3QJZ1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm21969J3QJZ1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm21969J3QJZ1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm21969J3QJZ1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm21969J3QJZ1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm21969J3QJZ1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm21969J3QJZ1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm21969J3QJZ1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm21969J3QJZ1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm21969J3QJZ1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms