Protein–RNA interactions for Protein: J3KMP5

Gm21897, Predicted gene, 21897, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21897J3KMP5 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm21897J3KMP5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm21897J3KMP5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm21897J3KMP5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm21897J3KMP5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm21897J3KMP5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm21897J3KMP5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm21897J3KMP5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm21897J3KMP5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm21897J3KMP5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm21897J3KMP5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm21897J3KMP5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm21897J3KMP5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm21897J3KMP5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm21897J3KMP5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm21897J3KMP5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm21897J3KMP5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm21897J3KMP5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm21897J3KMP5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm21897J3KMP5 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm21897J3KMP5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm21897J3KMP5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm21897J3KMP5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm21897J3KMP5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm21897J3KMP5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm21897J3KMP5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm21897J3KMP5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm21897J3KMP5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm21897J3KMP5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm21897J3KMP5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm21897J3KMP5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm21897J3KMP5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm21897J3KMP5 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm21897J3KMP5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm21897J3KMP5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm21897J3KMP5 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm21897J3KMP5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm21897J3KMP5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm21897J3KMP5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm21897J3KMP5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm21897J3KMP5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm21897J3KMP5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm21897J3KMP5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm21897J3KMP5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm21897J3KMP5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm21897J3KMP5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm21897J3KMP5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm21897J3KMP5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm21897J3KMP5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm21897J3KMP5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm21897J3KMP5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm21897J3KMP5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm21897J3KMP5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm21897J3KMP5 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm21897J3KMP5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm21897J3KMP5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm21897J3KMP5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm21897J3KMP5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm21897J3KMP5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm21897J3KMP5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm21897J3KMP5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm21897J3KMP5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm21897J3KMP5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm21897J3KMP5 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm21897J3KMP5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm21897J3KMP5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm21897J3KMP5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm21897J3KMP5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm21897J3KMP5 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm21897J3KMP5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm21897J3KMP5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm21897J3KMP5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm21897J3KMP5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm21897J3KMP5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm21897J3KMP5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm21897J3KMP5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm21897J3KMP5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm21897J3KMP5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm21897J3KMP5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm21897J3KMP5 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm21897J3KMP5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm21897J3KMP5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm21897J3KMP5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm21897J3KMP5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm21897J3KMP5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm21897J3KMP5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm21897J3KMP5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm21897J3KMP5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm21897J3KMP5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm21897J3KMP5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm21897J3KMP5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm21897J3KMP5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm21897J3KMP5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm21897J3KMP5 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm21897J3KMP5 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm21897J3KMP5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm21897J3KMP5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm21897J3KMP5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm21897J3KMP5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm21897J3KMP5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms