Protein–RNA interactions for Protein: I3ITR1

AK157302, MCG50313, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AK157302I3ITR1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
AK157302I3ITR1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AK157302I3ITR1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AK157302I3ITR1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AK157302I3ITR1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AK157302I3ITR1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AK157302I3ITR1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AK157302I3ITR1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
AK157302I3ITR1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
AK157302I3ITR1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AK157302I3ITR1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AK157302I3ITR1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AK157302I3ITR1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
AK157302I3ITR1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
AK157302I3ITR1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
AK157302I3ITR1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AK157302I3ITR1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AK157302I3ITR1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
AK157302I3ITR1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
AK157302I3ITR1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AK157302I3ITR1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AK157302I3ITR1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AK157302I3ITR1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AK157302I3ITR1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
AK157302I3ITR1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AK157302I3ITR1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AK157302I3ITR1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AK157302I3ITR1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AK157302I3ITR1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AK157302I3ITR1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AK157302I3ITR1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AK157302I3ITR1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AK157302I3ITR1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AK157302I3ITR1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AK157302I3ITR1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AK157302I3ITR1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AK157302I3ITR1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
AK157302I3ITR1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AK157302I3ITR1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AK157302I3ITR1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AK157302I3ITR1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AK157302I3ITR1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AK157302I3ITR1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AK157302I3ITR1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AK157302I3ITR1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AK157302I3ITR1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AK157302I3ITR1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AK157302I3ITR1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AK157302I3ITR1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
AK157302I3ITR1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AK157302I3ITR1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AK157302I3ITR1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AK157302I3ITR1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AK157302I3ITR1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AK157302I3ITR1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AK157302I3ITR1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AK157302I3ITR1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AK157302I3ITR1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AK157302I3ITR1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AK157302I3ITR1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
AK157302I3ITR1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AK157302I3ITR1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AK157302I3ITR1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AK157302I3ITR1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AK157302I3ITR1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AK157302I3ITR1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AK157302I3ITR1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AK157302I3ITR1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AK157302I3ITR1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AK157302I3ITR1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AK157302I3ITR1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AK157302I3ITR1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
AK157302I3ITR1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AK157302I3ITR1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AK157302I3ITR1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AK157302I3ITR1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AK157302I3ITR1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
AK157302I3ITR1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AK157302I3ITR1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AK157302I3ITR1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AK157302I3ITR1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AK157302I3ITR1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AK157302I3ITR1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AK157302I3ITR1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AK157302I3ITR1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AK157302I3ITR1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AK157302I3ITR1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AK157302I3ITR1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AK157302I3ITR1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AK157302I3ITR1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AK157302I3ITR1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AK157302I3ITR1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AK157302I3ITR1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AK157302I3ITR1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AK157302I3ITR1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AK157302I3ITR1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
AK157302I3ITR1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AK157302I3ITR1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
AK157302I3ITR1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AK157302I3ITR1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms