Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r34G3XA52 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r34G3XA52 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r34G3XA52 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r34G3XA52 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r34G3XA52 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r34G3XA52 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r34G3XA52 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r34G3XA52 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r34G3XA52 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r34G3XA52 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r34G3XA52 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r34G3XA52 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r34G3XA52 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r34G3XA52 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r34G3XA52 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn1r34G3XA52 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn1r34G3XA52 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn1r34G3XA52 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r34G3XA52 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r34G3XA52 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r34G3XA52 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r34G3XA52 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r34G3XA52 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r34G3XA52 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r34G3XA52 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r34G3XA52 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r34G3XA52 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r34G3XA52 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r34G3XA52 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r34G3XA52 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r34G3XA52 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r34G3XA52 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r34G3XA52 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r34G3XA52 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r34G3XA52 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r34G3XA52 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r34G3XA52 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r34G3XA52 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r34G3XA52 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r34G3XA52 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r34G3XA52 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r34G3XA52 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r34G3XA52 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r34G3XA52 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r34G3XA52 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r34G3XA52 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r34G3XA52 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r34G3XA52 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r34G3XA52 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r34G3XA52 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r34G3XA52 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r34G3XA52 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r34G3XA52 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r34G3XA52 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r34G3XA52 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r34G3XA52 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r34G3XA52 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r34G3XA52 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r34G3XA52 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r34G3XA52 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r34G3XA52 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r34G3XA52 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r34G3XA52 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r34G3XA52 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r34G3XA52 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r34G3XA52 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r34G3XA52 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r34G3XA52 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r34G3XA52 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r34G3XA52 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r34G3XA52 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r34G3XA52 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r34G3XA52 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r34G3XA52 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r34G3XA52 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r34G3XA52 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r34G3XA52 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r34G3XA52 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r34G3XA52 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r34G3XA52 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r34G3XA52 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r34G3XA52 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r34G3XA52 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r34G3XA52 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r34G3XA52 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r34G3XA52 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r34G3XA52 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r34G3XA52 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vmn1r34G3XA52 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vmn1r34G3XA52 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r34G3XA52 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r34G3XA52 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r34G3XA52 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r34G3XA52 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r34G3XA52 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r34G3XA52 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r34G3XA52 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r34G3XA52 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r34G3XA52 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms