Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Arfgef1G3X9K3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Arfgef1G3X9K3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Arfgef1G3X9K3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Arfgef1G3X9K3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Arfgef1G3X9K3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Arfgef1G3X9K3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Arfgef1G3X9K3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Arfgef1G3X9K3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Arfgef1G3X9K3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Arfgef1G3X9K3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Arfgef1G3X9K3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Arfgef1G3X9K3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Arfgef1G3X9K3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Arfgef1G3X9K3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Arfgef1G3X9K3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Arfgef1G3X9K3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Arfgef1G3X9K3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Arfgef1G3X9K3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Arfgef1G3X9K3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Arfgef1G3X9K3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Arfgef1G3X9K3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Arfgef1G3X9K3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Arfgef1G3X9K3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Arfgef1G3X9K3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Arfgef1G3X9K3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Arfgef1G3X9K3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Arfgef1G3X9K3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Arfgef1G3X9K3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Arfgef1G3X9K3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Arfgef1G3X9K3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Arfgef1G3X9K3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Arfgef1G3X9K3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Arfgef1G3X9K3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Arfgef1G3X9K3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Arfgef1G3X9K3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Arfgef1G3X9K3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Arfgef1G3X9K3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Arfgef1G3X9K3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Arfgef1G3X9K3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Arfgef1G3X9K3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Arfgef1G3X9K3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Arfgef1G3X9K3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Arfgef1G3X9K3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Arfgef1G3X9K3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Arfgef1G3X9K3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Arfgef1G3X9K3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Arfgef1G3X9K3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Arfgef1G3X9K3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Arfgef1G3X9K3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Arfgef1G3X9K3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Arfgef1G3X9K3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Arfgef1G3X9K3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Arfgef1G3X9K3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Arfgef1G3X9K3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Arfgef1G3X9K3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Arfgef1G3X9K3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Arfgef1G3X9K3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Arfgef1G3X9K3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Arfgef1G3X9K3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Arfgef1G3X9K3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Arfgef1G3X9K3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Arfgef1G3X9K3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Arfgef1G3X9K3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Arfgef1G3X9K3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Arfgef1G3X9K3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Arfgef1G3X9K3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Arfgef1G3X9K3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Arfgef1G3X9K3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Arfgef1G3X9K3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Arfgef1G3X9K3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Arfgef1G3X9K3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Arfgef1G3X9K3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Arfgef1G3X9K3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Arfgef1G3X9K3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Arfgef1G3X9K3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Arfgef1G3X9K3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Arfgef1G3X9K3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Arfgef1G3X9K3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Arfgef1G3X9K3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Arfgef1G3X9K3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Arfgef1G3X9K3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Arfgef1G3X9K3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Arfgef1G3X9K3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Arfgef1G3X9K3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Arfgef1G3X9K3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Arfgef1G3X9K3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Arfgef1G3X9K3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Arfgef1G3X9K3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Arfgef1G3X9K3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Arfgef1G3X9K3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Arfgef1G3X9K3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Arfgef1G3X9K3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Arfgef1G3X9K3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Arfgef1G3X9K3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Arfgef1G3X9K3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Arfgef1G3X9K3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Arfgef1G3X9K3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Arfgef1G3X9K3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Arfgef1G3X9K3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms