Protein–RNA interactions for Protein: G3X9F6

Sh3tc1, SH3 domain and tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3tc1G3X9F6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sh3tc1G3X9F6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh3tc1G3X9F6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh3tc1G3X9F6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh3tc1G3X9F6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh3tc1G3X9F6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh3tc1G3X9F6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh3tc1G3X9F6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh3tc1G3X9F6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh3tc1G3X9F6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh3tc1G3X9F6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh3tc1G3X9F6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh3tc1G3X9F6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh3tc1G3X9F6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sh3tc1G3X9F6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sh3tc1G3X9F6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Sh3tc1G3X9F6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sh3tc1G3X9F6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sh3tc1G3X9F6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sh3tc1G3X9F6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sh3tc1G3X9F6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sh3tc1G3X9F6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Sh3tc1G3X9F6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sh3tc1G3X9F6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sh3tc1G3X9F6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sh3tc1G3X9F6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sh3tc1G3X9F6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sh3tc1G3X9F6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sh3tc1G3X9F6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sh3tc1G3X9F6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Sh3tc1G3X9F6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sh3tc1G3X9F6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sh3tc1G3X9F6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sh3tc1G3X9F6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sh3tc1G3X9F6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sh3tc1G3X9F6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Sh3tc1G3X9F6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sh3tc1G3X9F6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sh3tc1G3X9F6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sh3tc1G3X9F6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sh3tc1G3X9F6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sh3tc1G3X9F6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sh3tc1G3X9F6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sh3tc1G3X9F6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sh3tc1G3X9F6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sh3tc1G3X9F6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Sh3tc1G3X9F6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sh3tc1G3X9F6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sh3tc1G3X9F6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sh3tc1G3X9F6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sh3tc1G3X9F6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sh3tc1G3X9F6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sh3tc1G3X9F6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sh3tc1G3X9F6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Sh3tc1G3X9F6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sh3tc1G3X9F6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sh3tc1G3X9F6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sh3tc1G3X9F6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sh3tc1G3X9F6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sh3tc1G3X9F6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sh3tc1G3X9F6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sh3tc1G3X9F6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sh3tc1G3X9F6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sh3tc1G3X9F6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sh3tc1G3X9F6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sh3tc1G3X9F6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sh3tc1G3X9F6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sh3tc1G3X9F6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sh3tc1G3X9F6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Sh3tc1G3X9F6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Sh3tc1G3X9F6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sh3tc1G3X9F6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sh3tc1G3X9F6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sh3tc1G3X9F6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sh3tc1G3X9F6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sh3tc1G3X9F6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sh3tc1G3X9F6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sh3tc1G3X9F6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sh3tc1G3X9F6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sh3tc1G3X9F6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sh3tc1G3X9F6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sh3tc1G3X9F6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sh3tc1G3X9F6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sh3tc1G3X9F6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sh3tc1G3X9F6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sh3tc1G3X9F6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sh3tc1G3X9F6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sh3tc1G3X9F6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sh3tc1G3X9F6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sh3tc1G3X9F6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sh3tc1G3X9F6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sh3tc1G3X9F6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sh3tc1G3X9F6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sh3tc1G3X9F6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sh3tc1G3X9F6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sh3tc1G3X9F6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sh3tc1G3X9F6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sh3tc1G3X9F6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sh3tc1G3X9F6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sh3tc1G3X9F6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms