Protein–RNA interactions for Protein: G3UXB3

Nkx1-1, NK1 homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-1G3UXB3 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nkx1-1G3UXB3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Nkx1-1G3UXB3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nkx1-1G3UXB3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nkx1-1G3UXB3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nkx1-1G3UXB3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nkx1-1G3UXB3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nkx1-1G3UXB3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nkx1-1G3UXB3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nkx1-1G3UXB3 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Nkx1-1G3UXB3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nkx1-1G3UXB3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nkx1-1G3UXB3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nkx1-1G3UXB3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nkx1-1G3UXB3 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Nkx1-1G3UXB3 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nkx1-1G3UXB3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nkx1-1G3UXB3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Nkx1-1G3UXB3 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nkx1-1G3UXB3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nkx1-1G3UXB3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Nkx1-1G3UXB3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nkx1-1G3UXB3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nkx1-1G3UXB3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nkx1-1G3UXB3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nkx1-1G3UXB3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nkx1-1G3UXB3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Nkx1-1G3UXB3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Nkx1-1G3UXB3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nkx1-1G3UXB3 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Nkx1-1G3UXB3 AC142191.1-201ENSMUST00000219217 699 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nkx1-1G3UXB3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nkx1-1G3UXB3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nkx1-1G3UXB3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nkx1-1G3UXB3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nkx1-1G3UXB3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nkx1-1G3UXB3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nkx1-1G3UXB3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nkx1-1G3UXB3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nkx1-1G3UXB3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nkx1-1G3UXB3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nkx1-1G3UXB3 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Nkx1-1G3UXB3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nkx1-1G3UXB3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nkx1-1G3UXB3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nkx1-1G3UXB3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nkx1-1G3UXB3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nkx1-1G3UXB3 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Nkx1-1G3UXB3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nkx1-1G3UXB3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nkx1-1G3UXB3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nkx1-1G3UXB3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nkx1-1G3UXB3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nkx1-1G3UXB3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nkx1-1G3UXB3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nkx1-1G3UXB3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nkx1-1G3UXB3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nkx1-1G3UXB3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nkx1-1G3UXB3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nkx1-1G3UXB3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nkx1-1G3UXB3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nkx1-1G3UXB3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nkx1-1G3UXB3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nkx1-1G3UXB3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nkx1-1G3UXB3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nkx1-1G3UXB3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nkx1-1G3UXB3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nkx1-1G3UXB3 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nkx1-1G3UXB3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nkx1-1G3UXB3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nkx1-1G3UXB3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nkx1-1G3UXB3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nkx1-1G3UXB3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nkx1-1G3UXB3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nkx1-1G3UXB3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nkx1-1G3UXB3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nkx1-1G3UXB3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nkx1-1G3UXB3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nkx1-1G3UXB3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nkx1-1G3UXB3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nkx1-1G3UXB3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nkx1-1G3UXB3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nkx1-1G3UXB3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nkx1-1G3UXB3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Nkx1-1G3UXB3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Nkx1-1G3UXB3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Nkx1-1G3UXB3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nkx1-1G3UXB3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Nkx1-1G3UXB3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nkx1-1G3UXB3 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Nkx1-1G3UXB3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nkx1-1G3UXB3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nkx1-1G3UXB3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nkx1-1G3UXB3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nkx1-1G3UXB3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nkx1-1G3UXB3 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nkx1-1G3UXB3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nkx1-1G3UXB3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Nkx1-1G3UXB3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nkx1-1G3UXB3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms