Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Farp1F8VPU2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Farp1F8VPU2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Farp1F8VPU2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Farp1F8VPU2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Farp1F8VPU2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Farp1F8VPU2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Farp1F8VPU2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Farp1F8VPU2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Farp1F8VPU2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Farp1F8VPU2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Farp1F8VPU2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Farp1F8VPU2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Farp1F8VPU2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Farp1F8VPU2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Farp1F8VPU2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Farp1F8VPU2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Farp1F8VPU2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Farp1F8VPU2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Farp1F8VPU2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Farp1F8VPU2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Farp1F8VPU2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Farp1F8VPU2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Farp1F8VPU2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Farp1F8VPU2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Farp1F8VPU2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Farp1F8VPU2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Farp1F8VPU2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Farp1F8VPU2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Farp1F8VPU2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Farp1F8VPU2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Farp1F8VPU2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Farp1F8VPU2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Farp1F8VPU2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Farp1F8VPU2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Farp1F8VPU2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Farp1F8VPU2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Farp1F8VPU2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Farp1F8VPU2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Farp1F8VPU2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Farp1F8VPU2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Farp1F8VPU2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Farp1F8VPU2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Farp1F8VPU2 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Farp1F8VPU2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Farp1F8VPU2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Farp1F8VPU2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Farp1F8VPU2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Farp1F8VPU2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Farp1F8VPU2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Farp1F8VPU2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Farp1F8VPU2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Farp1F8VPU2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Farp1F8VPU2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Farp1F8VPU2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Farp1F8VPU2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Farp1F8VPU2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Farp1F8VPU2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Farp1F8VPU2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Farp1F8VPU2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Farp1F8VPU2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Farp1F8VPU2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Farp1F8VPU2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Farp1F8VPU2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Farp1F8VPU2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Farp1F8VPU2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Farp1F8VPU2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Farp1F8VPU2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Farp1F8VPU2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Farp1F8VPU2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Farp1F8VPU2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Farp1F8VPU2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Farp1F8VPU2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Farp1F8VPU2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Farp1F8VPU2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Farp1F8VPU2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Farp1F8VPU2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Farp1F8VPU2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Farp1F8VPU2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Farp1F8VPU2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Farp1F8VPU2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Farp1F8VPU2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Farp1F8VPU2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Farp1F8VPU2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Farp1F8VPU2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Farp1F8VPU2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Farp1F8VPU2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Farp1F8VPU2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Farp1F8VPU2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Farp1F8VPU2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Farp1F8VPU2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Farp1F8VPU2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Farp1F8VPU2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Farp1F8VPU2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Farp1F8VPU2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Farp1F8VPU2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Farp1F8VPU2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Farp1F8VPU2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Farp1F8VPU2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Farp1F8VPU2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms