Protein–RNA interactions for Protein: F8VPQ2

Arid4a, AT-rich interactive domain 4A (RBP1-like), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid4aF8VPQ2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Arid4aF8VPQ2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Arid4aF8VPQ2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Arid4aF8VPQ2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Arid4aF8VPQ2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Arid4aF8VPQ2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Arid4aF8VPQ2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Arid4aF8VPQ2 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Arid4aF8VPQ2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Arid4aF8VPQ2 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Arid4aF8VPQ2 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Arid4aF8VPQ2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Arid4aF8VPQ2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Arid4aF8VPQ2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Arid4aF8VPQ2 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Arid4aF8VPQ2 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Arid4aF8VPQ2 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Arid4aF8VPQ2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Arid4aF8VPQ2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Arid4aF8VPQ2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Arid4aF8VPQ2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Arid4aF8VPQ2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Arid4aF8VPQ2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Arid4aF8VPQ2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Arid4aF8VPQ2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Arid4aF8VPQ2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Arid4aF8VPQ2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Arid4aF8VPQ2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Arid4aF8VPQ2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Arid4aF8VPQ2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Arid4aF8VPQ2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Arid4aF8VPQ2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Arid4aF8VPQ2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Arid4aF8VPQ2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Arid4aF8VPQ2 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Arid4aF8VPQ2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Arid4aF8VPQ2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Arid4aF8VPQ2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Arid4aF8VPQ2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Arid4aF8VPQ2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Arid4aF8VPQ2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Arid4aF8VPQ2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Arid4aF8VPQ2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Arid4aF8VPQ2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Arid4aF8VPQ2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Arid4aF8VPQ2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Arid4aF8VPQ2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Arid4aF8VPQ2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Arid4aF8VPQ2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Arid4aF8VPQ2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Arid4aF8VPQ2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Arid4aF8VPQ2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Arid4aF8VPQ2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Arid4aF8VPQ2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Arid4aF8VPQ2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Arid4aF8VPQ2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Arid4aF8VPQ2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Arid4aF8VPQ2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Arid4aF8VPQ2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Arid4aF8VPQ2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Arid4aF8VPQ2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Arid4aF8VPQ2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Arid4aF8VPQ2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Arid4aF8VPQ2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Arid4aF8VPQ2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Arid4aF8VPQ2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Arid4aF8VPQ2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Arid4aF8VPQ2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Arid4aF8VPQ2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Arid4aF8VPQ2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Arid4aF8VPQ2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Arid4aF8VPQ2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Arid4aF8VPQ2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Arid4aF8VPQ2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Arid4aF8VPQ2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Arid4aF8VPQ2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Arid4aF8VPQ2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Arid4aF8VPQ2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Arid4aF8VPQ2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Arid4aF8VPQ2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Arid4aF8VPQ2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Arid4aF8VPQ2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Arid4aF8VPQ2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Arid4aF8VPQ2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Arid4aF8VPQ2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Arid4aF8VPQ2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Arid4aF8VPQ2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Arid4aF8VPQ2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Arid4aF8VPQ2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Arid4aF8VPQ2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Arid4aF8VPQ2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Arid4aF8VPQ2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Arid4aF8VPQ2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Arid4aF8VPQ2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Arid4aF8VPQ2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Arid4aF8VPQ2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Arid4aF8VPQ2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Arid4aF8VPQ2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Arid4aF8VPQ2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Arid4aF8VPQ2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms