Protein–RNA interactions for Protein: F6V0H0

Pagr1b, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1B (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1bF6V0H0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pagr1bF6V0H0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Pagr1bF6V0H0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pagr1bF6V0H0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pagr1bF6V0H0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pagr1bF6V0H0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pagr1bF6V0H0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pagr1bF6V0H0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pagr1bF6V0H0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pagr1bF6V0H0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pagr1bF6V0H0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pagr1bF6V0H0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pagr1bF6V0H0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pagr1bF6V0H0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pagr1bF6V0H0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pagr1bF6V0H0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pagr1bF6V0H0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pagr1bF6V0H0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pagr1bF6V0H0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pagr1bF6V0H0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pagr1bF6V0H0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pagr1bF6V0H0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pagr1bF6V0H0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pagr1bF6V0H0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pagr1bF6V0H0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pagr1bF6V0H0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Pagr1bF6V0H0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pagr1bF6V0H0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pagr1bF6V0H0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Pagr1bF6V0H0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pagr1bF6V0H0 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pagr1bF6V0H0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Pagr1bF6V0H0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pagr1bF6V0H0 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Pagr1bF6V0H0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Pagr1bF6V0H0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pagr1bF6V0H0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pagr1bF6V0H0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pagr1bF6V0H0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pagr1bF6V0H0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pagr1bF6V0H0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pagr1bF6V0H0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pagr1bF6V0H0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pagr1bF6V0H0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pagr1bF6V0H0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pagr1bF6V0H0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pagr1bF6V0H0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pagr1bF6V0H0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pagr1bF6V0H0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pagr1bF6V0H0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pagr1bF6V0H0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pagr1bF6V0H0 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pagr1bF6V0H0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pagr1bF6V0H0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pagr1bF6V0H0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pagr1bF6V0H0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pagr1bF6V0H0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pagr1bF6V0H0 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pagr1bF6V0H0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Pagr1bF6V0H0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Pagr1bF6V0H0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Pagr1bF6V0H0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pagr1bF6V0H0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pagr1bF6V0H0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pagr1bF6V0H0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pagr1bF6V0H0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pagr1bF6V0H0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pagr1bF6V0H0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pagr1bF6V0H0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pagr1bF6V0H0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pagr1bF6V0H0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pagr1bF6V0H0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pagr1bF6V0H0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pagr1bF6V0H0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pagr1bF6V0H0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Pagr1bF6V0H0 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pagr1bF6V0H0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Pagr1bF6V0H0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Pagr1bF6V0H0 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pagr1bF6V0H0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pagr1bF6V0H0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pagr1bF6V0H0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Pagr1bF6V0H0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pagr1bF6V0H0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pagr1bF6V0H0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pagr1bF6V0H0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pagr1bF6V0H0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pagr1bF6V0H0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pagr1bF6V0H0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pagr1bF6V0H0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pagr1bF6V0H0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pagr1bF6V0H0 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pagr1bF6V0H0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pagr1bF6V0H0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pagr1bF6V0H0 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pagr1bF6V0H0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pagr1bF6V0H0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pagr1bF6V0H0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pagr1bF6V0H0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pagr1bF6V0H0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms